dna-binding

E3330 是一种口服有效的选择性 AP 内切核酸酶 1 (APE1; REF-1) 抑制剂，可抑制NF-κB DNA 结合活性。它阻断 TNF-α 诱导的肝癌细胞系中 IL-8 的激活，可以抑制癌细胞的生长和迁移，具有抗癌活性。

Kamebakaurin (Kamebakaurine) 是一种提取自Isodon japonicus 中的天然产物，是一种NF-κB 的抑制剂，能够抑制 p50 的 DNA 结合活性。

DB1255 2TFA 是一种 ERG/DNA 结合抑制剂，在小沟位点具有不寻常且强大的单体结合模式，可用于研究基因病。

AGX51 是 DNA 结合蛋白抑制剂 (ID) 的拮抗剂。 AGX51 治疗导致泛 Id 降解、细胞周期停滞和细胞死亡。

HLM006474 是光谱的E2F 抑制剂，在 A375 细胞中，可抑制 E2F4 DAN 结合(IC50:29.8 µM)。

AK-778-XXMU 是一种 ID2 拮抗剂， KD值为 129 nM。AK-778-XXMU 具有潜在的抗肿瘤抗癌活性，可用于研究神经胶质瘤。

DTHIB 是一种选择性热休克蛋白 1 的直接抑制剂，与 HSF1 DNA 结合域结合的Kd 为 160 nM。它选择性刺激核HSF1的降解，强烈抑制 HSF1 癌症基因特征和前列腺癌细胞增殖。

2',3'-cGAMP sodium (2'-3'-cyclic GMP-AMP sodium) 是细胞天然免疫中第二信使，在 DNA 结合条件下由 cGAMP 合成酶 (cGAS) 催化形成。2',3'-cGAMP sodium 可与 STING 结合形成二聚体，诱导 IFN-β 及其他细胞因子的产生和表达。

Calf thymus DNA (DNA from calf thymus, Thymonucleic acid) 是一种从牛胸腺中提取出来的高质量双链模板DNA，可广泛应用于DNA 结合抗癌剂和调节DNA 结构和功能的DNA 结合剂的研究。

AOH1996 是一种具有口服活性的复制体组分 PCNA (增殖细胞核抗原) 配体，靶向转录-复制冲突 (TRC)。AOH1996 可干扰 PCNA 与其结合蛋白的相互作用，导致 DNA 复制应激，诱导细胞凋亡 (apoptosis)。AOH1996 通过稳定 PCNA 和 RNA 聚合酶 II 的相互作用从而导致蛋白酶体依赖的 rpb1 降解和致命的 DNA 损伤。AOH1996 与 DNA 损伤剂具有协同作用，可抑制肿瘤细胞生长。

DB1976 是一种 DB270 的硒烯类似物，是一种高效且可渗透细胞的转录因子 PU.1 的抑制剂。在体外，DB1976 有效抑制 PU.1 结合 (IC50 为 10 nM)，可强烈抑制 PU.1/DNA 复合物 (具有高 DB1976-λB 亲和力，KD 为 12 nM)。DB1976 具有诱导细胞凋亡的作用。

Aldoxorubicin hydrochloride 是 Doxorubicin (DNA 拓扑异构酶 II 抑制剂) 的白蛋白结合前药。Aldoxorubicin hydrochloride 在酸性条件下从白蛋白中释放出来。 Aldoxorubicin hydrochloride 显示出有效的抗肿瘤活性。

inS3-54-A26 是 STAT3 的 DNA 结合域的抑制剂。 inS3-54-A26 抑制肿瘤生长、转移和 STAT3 的基因表达。

P53R3是一种有效的 p53再激活剂。P53R3可恢复 p53热点突变体的序列特异性 DNA 结合，包括p53 R175H、p53 R248W 和p53 R273H。P53R3特异性诱导p53依赖性抗增殖作用，其特异性比PRIMA-1高得多的。P53R3增强野生型p53和p53 M237I 向靶基因启动子的募集。P53R3强烈增强死亡受体死亡受体5（DR5）的mRNA、总蛋白和细胞表面的水平。P53R3用于癌症研究。

DB1255 is a ERG/DNA binding inhibitor which targets the DNA-binding activity of the human ERG transcription factor.

VPC-70619是一种 N-Myc 抑制剂，具有有效性、口服活性和选择性。VPC-70619通过阻止 N-Myc-Max 化合物与 DNA 的 E-box 结合从而抑制癌细胞生长，对 N-Myc 依赖性细胞系显示出的强烈的抑制活性，并且可通过口服或腹腔内给药途径有效地被机体吸收和利用。

Tetramethylcurcumin 是一种新型姜黄素类似物，是一种有效的 STAT3 磷酸化、DNA 结合活性和体外反式激活抑制剂。它具有抗炎和抗癌作用。

Zalcitabine (Dideoxycytidine) 是一种核苷类似物逆转录酶抑制剂，用于HIV 感染相关研究。

Emamectin Benzoate (MK-244) 是口服有效的神经系统毒物，其通过结合昆虫中的 GABA 受体发挥作用。它是阿维菌素的半合成衍生物之一，具有广谱的杀虫和杀螨活性。它诱导ROS 介导的 DNA 损伤和细胞凋亡。

Penciclovir (BRL 39123) 是一种疱疹病毒核苷类似物 DNA 聚合酶抑制剂。它作用于HSV1 和 2，IC50分别为 0.04-1.8 μg/mL 和 0.06-4.4 μg/mL。

EDC hydrochloride (EDC-HCl Crosslinker) 是一种水溶性的碳二亚胺类化合物。EDC hydrochloride 作为缩合剂，通过羧基和氨基的缩合反应形成肽键，可用于合成具有特定序列和功能的肽。EDC hydrochloride 可将半抗原共价结合到载体蛋白上，形成免疫抗原，用于疫苗研究。EDC hydrochloride 能够与核酸的5′磷酸基团反应，用于 DNA 和 RNA 的标记。EDC hydrochloride 可将蛋白质与核酸交联，用于制备免疫交联物。EDC hydrochloride 作为交联剂，连接生物分子的胺反应性 NHS 酯与羧基，可用于蛋白质偶联，创造具有新特性和功能的杂交分子。

Zebularine (4-Deoxyuridine) 是一种 DNA 甲基化抑制剂，还抑制胞苷脱氨酶。它通过以共价水合物的形式与活性大小结合，充当胞苷脱氨酶的过渡态类似物抑制剂。

2-Methoxyestradiol (2-ME2) 是一种口服生物可利用的雌二醇代谢物，具有抗肿瘤活性。它通过减少内皮细胞增殖和诱导内皮细胞凋亡来抑制血管生成，也可破坏微管的稳定。它可诱导半胱天冬酶活化，导致细胞周期停滞在 G2 期、DNA 断裂和细胞凋亡。

Pentamidine 是抗微生物剂，会干扰 DNA 的生物合成。它是选择性蛋白酪氨酸磷酸酶和再生肝磷酸酶抑制剂。它可用于冈比亚锥虫病，抗锑利什曼病和卡氏肺孢子虫肺炎的研究，有抗肿瘤活性，抗菌活性。