表观遗传筛选化合物库

Focused Epigenetics Set

很棒

在设计我们的"表观遗传学"靶向库时，我们针对几个特定的表观遗传蛋白家族进行了考虑，包括： 编写者（Lys、Arg 或DNA 甲基转移酶） 擦除者（HDACs 和SirTs） 读者（结合PTMs 的蛋白质/结构域，例如Bromodomains） 具体而言，在组装这些靶向家族的小分子调节剂时，考虑了三个关键策略，包括： 已知/“疑似”的配体（基于配体的选择） “替代”结构-功能信息（突变、同源/同源异构体结构建模等） “湿”结构生物学（晶体学或NMR），提供更“准确”的建模环境，以识别药效模型和“热点” 此外，我们还考虑了配体的药物/引物特性（分子量、亲脂性、细胞渗透性潜力），包括潜在的缺陷（RedOx、共价键形成、“活性反应”物种等）。 下面是分析并填充了专注的小分子配体及其类似物的代表性靶向选择： HDAC I-IV 类：迄今为止研究广泛的表观遗传学蛋白质家族；重要的是，我们确实包括泛和“优先”（例如，IIa 类）抑制剂；根据你的筛查和治疗需求，这些可能是有用的 值得注意的是，尽管有几种特征良好的III 类HDAC（SirT）抑制剂，但仍缺乏各自的直接激活剂；为了弥补这种“不足”，我们在SirT1的内部模型中加入了一组小分子，这些小分子反映了包括变构调节在内的多种药理学思想 HAT（组蛋白N-乙酰转移酶），例如p300、Gcn5、EZH2、EHMT2、DOT1L、SU（VAR）3-9 组蛋白脱甲基酶，例如KDM1A、KDM5B、JMJD2、H3K27、PARP1 PRMT（蛋白质精氨酸甲基转移酶），例如CARM1、PRMT4、PRMT5；将多个系列模拟到关键的蛋白质-蛋白质相互作用PRMT5:MeP50中，以产生用于该特定界面的化合物子集 溴代烷，例如BRD2-4、BRDT、PHIP, WDR9, TAF1, TIF1

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