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质子泵是一种完整的膜蛋白泵,可以在生物膜上建立质子梯度。在进化过程中,质子泵曾多次独立出现。因此,不仅在自然界中,而且在单个细胞内,都可以发现进化上无关的不同质子泵。质子泵分为不同的主要泵类,它们使用不同的能量来源,具有不同的多肽组成和进化起源。