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关键特性
近期关于PPI片段的研究表明,由于作用界面较大,相比常规片段通常需要更高分子量的化合物。因此,我们运用“四原则”筛选规则初步提取PPI片段子集,这类片段通常具有更大分子量和更高亲脂性。此外,采用结合经验证描述符的机器学习方法(决策树)进一步优化了片段库。
“热点”概念在设计中得到应用,即聚焦参与PPI的关键氨基酸残基。大量所选片段含有与这些热点相对应的基团/结构单元。同时,库中富集了具有类α螺旋结构的分子,以模拟蛋白质基序。由于氢键在PPI中常起关键作用,我们优先选择至少含一个氢键供体(>70%)和一个氢键受体(100%)的分子。
分子举例
分子特性





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