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LF Covalent Fragment Library
共价化学探针已成为药物研究的热点。通过临床试验或获得FDA批准的具有共价作用机制的候选药物数量显著增加;市场上大约30%的药物是共价抑制剂。这种抑制具有许多理想的特征,包括靶点破坏的生物化学效率更高,对药代动力学参数的敏感性更低,以及比化合物的药代动力学更持久的作用持续时间增加。
考虑到人们对基于片段的药物发现越来越感兴趣和广泛使用,我们设计了一个共价抑制剂片段的独家集合。首先,所有化合物均根据“三规则”标准进行筛选。随后,通过挑选出具有特定结构片段(功能基团、反应基团)的化合物,初步构建了一组共价修饰剂,这些片段已知能够与目标蛋白结合位点中的氨基酸残基(如赖氨酸、半胱氨酸、丝氨酸、组氨酸和酪氨酸)形成共价键。
由此产生的共价片段库包含约6,100种小分子化合物,用于共价片段筛选。
以下化学类别及结构片段被用于排列潜在的共价抑制剂:
SD文件中的每个化合物都包含其结构内存在的共价弹头类型信息。此外,名为"共价弹头分布"的文件还详细记录了属于特定官能团或其组合的化合物数量信息。
