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Representative Compounds Library (Bemis-Murcko Clustering Algorithm)
300k代表性化合物库是基于生成Bemis-Murcko骨架,过滤和三类挑选构建而成。 现货产品,包含100k 种化合物,货期更短,性价比更高,欢迎咨询!
TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究,不能被用于人体,我们也不向个人提供产品和服务。
对整个160万ChemDiv库中的每个化合物生成Bemis-Murcko骨架(BMS)。
应用REOS、MedChem和PAINS过滤器,以去除反应性、有毒、多效性和其他不良的结构基团。
然后应用物理化学性质过滤器,以去除非药物样化合物。
对剩余的化合物选择,为每个化合物生成Bemis-Murcko骨架(BMS),计算每个BMS的唯一数量和每个BMS中的化合物数量。
将选择分为3个类别,用于将来进行聚类和多样性选择:
a. 每个唯一BMS的个体分子数量:1-3
b. 每个唯一BMS的个体分子数量:4-1000
c. 每个唯一BMS的个体分子数量:>1000
使用RDKit MaxMin算法(Tanimoto,ECFP4,2048位)针对每个类别中的每个BMS逐步选择(即聚类)个体分子。聚类大小(即每个BMS中选择的个体分子数量)由以下公式计算:
将所有3个选择合并为30万个化合物集合。
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