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代表性核心库(基于Bemis-Murcko Clustering算法)现货

Representative Compounds Library (Bemis-Murcko Clustering Algorithm)

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产品编号 DD3700

300k代表性化合物库是基于生成Bemis-Murcko骨架,过滤和三类挑选构建而成。

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究,不能被用于人体,我们也不向个人提供产品和服务。

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产品编号 DD3700

代表性核心库(基于Bemis-Murcko Clustering算法)

规格

  • 30 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 50 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 250 μL x 10 mM (in DMSO)
询价 & 定制

产品描述 产品描述

从ChemDiv 160万库存中基于Bemis-Murcko聚类工作流程筛选出的30万多样化选择:

  1. 为整个160万ChemDiv库存中的每个分子生成Bemis-Murcko骨架(BMS)
  2. 应用REOS、MedChem和PAINS过滤器去除反应性、毒性、混杂性及其他不良结构基团
  3. 然后应用物理化学性质过滤器去除非药物样分子
  4. 对于剩余的选择,为每个分子生成Bemis-Murcko骨架(BMS),计算唯一BMS的数量及每个BMS对应的分子数量
  5. 将选择分为三类以便未来聚类和多样性挑选:
    a. 每个唯一BMS对应的单个分子数量:1-3
    b. 每个唯一BMS对应的单个分子数量:4-1000
    c. 每个唯一BMS对应的单个分子数量:>1000
  6. 使用RDKit MaxMin算法(Tanimoto,ECFP4,2048位)在每个类别内对每个BMS的单个分子进行迭代选择(即聚类),聚类大小(即每个BMS挑选的单个分子数量)通过公式计算
  7. 将所有三类选择合并为最终的30万集合

Packaging And Storage | TargetMol 包装和储存

  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

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