表观遗传

Bomedemstat（IMG-7289）是一种口服活性、不可逆的赖氨酸特异性去甲基酶1（LSD1）抑制剂，在小鼠骨髓增生性肿瘤（MPNs）模型中显示活性。该化合物具有抗肿瘤作用，可用于急性髓系白血病（AML）和骨髓纤维化（MF）研究。

GNE-375 是一种具有选择性和高效性的 BRD9 抑制剂，(IC50：5 nM)。GNE-375 抑制 BRD4、TAF1 和 CECR2，可用于研究表观遗传学耐药性。

TAK-418 是一种选择性、口服活性 LSD1/KDM1A 酶抑制剂，IC50 为 2.9 nM。TAK-418 能解锁异常表观遗传机制，改善神经发育障碍模型中的自闭症症状。

MU1656 是一种高效且选择性的组蛋白甲基转移酶 DOT1L 抑制剂（IC50＝2 nM）。DOT1L 是一种关键的表观遗传调控蛋白，参与血液系统恶性肿瘤等癌症的发展，从而MU1656能够显著抑制癌细胞的增殖并诱导细胞凋亡。

TCIP 1是一款转录 表观遗传CIPs（TCIP）小分子，结构上为能够分别与BCL6和BRD4结合的小分子共价连接而成。该分子通过募集内源性癌症驱动因子或下游转录因子至细胞死亡基因的启动子，促进胞死亡基因的表达。TCIP 1能形成功能性三元复合物，特异性地与BCL6和BRD4作用，从而取消BCL6对凋亡基因的抑制，增强促凋亡基因的转录活性，并触发细胞凋亡。此外，TCIP 1有效降低致癌基因MYC的表达，并抑制弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的增长。

Oxybenzone 是晒黑和皮肤保护剂中常用的紫外线过滤剂。它是二苯甲酮的衍生物，用作破坏内分泌的化学物质，可穿透胎盘和血脑屏障。它损害自噬，改变表观遗传状态并破坏凋亡神经元细胞中的类维生素 X 受体信号传导。

Cytosine (6-Aminopyrimidin-2(1H)-one) 是 DNA 和 RNA 中发现的四个主要碱基之一。它修饰表现出与表观遗传多样性和衰老有关的昼夜节律振荡。

5-Methylcytosine 是一种存在于真核 DNA 中的甲基化核苷酸碱基。它是由 DNA 甲基转移酶作用形成的表观遗传修饰。

Larsucosterol ammonium salt(拉舒胆醇铵盐)是Larsucosterol(DUR-928)的盐形式和25HC3S的衍生物。Larsucosterol是一种DNA甲基转移酶抑制剂(DNMT)，是一种有效的肝 X 受体 (LXR) 拮抗剂，一种内源性硫酸氧甾醇和一种表观遗传调节剂，能够调节脂质代谢，减少炎症，治疗肝病。

UNC0638 是 β-蛋白赖氨酸甲基转移酶 G9a 和 GLP 的抑制剂，选择性抑制表观遗传和非表观遗传靶标。

RRx-001 是一种低氧选择性的表观遗传因子，被用作放射或化疗敏感剂，能诱发凋亡，克服骨髓瘤的耐药性。它是G6PD 的有效抑制剂，具有抗疟、抗癌活性。它是免疫检查点的抑制剂，可下调CD47和SIRP-α。

(Z)-JIB-04 (NSC 693627) 是 JIB-04 的 Z 型异构体。其中 JIB-04 有 E 型和 Z 型异构体两种形式。而(Z)-JIB-04 (NSC 693627) 在表观遗传分析中无活性。

BAY-474 是酪氨酸蛋白激酶 c-MET 抑制剂，能够用于表观遗传学探针。

L-2-Hydroxyglutaric acid disodium ((S)-2-Hydroxyglutaric acid disodium) 是一种表观遗传修饰因子，是肾癌中的表观遗传修饰剂和推定的癌代谢物，可用于肾癌的相关研究。它抑制线粒体肌酸激酶活性，Km 和 Ki 分别为 2.52 mM 和11.13 mM。它可抑制组蛋白去甲基化酶，从而促进组蛋白甲基化。

LP99 是一种表观遗传探针，可破坏 BRD7 和 BRD9 与细胞中染色质的结合。它是一种选择性的 BRD7 和 BRD9 溴结构域抑制剂，对 BRD9 的 Kd 为 99 nM。

3-Phosphoglyceric acid (Glycerate 3-phosphate) 属于糖酸类衍生物，参与糖酵解和卡尔文循环，参与肺泡巨噬细胞的表观遗传调控，是一种常见的生物标记物。

ESI1 是一种作用于表观遗传的小分子沉默抑制剂。该化合物能促使关键的脂质代谢调控因子 SREBP1 2 形成核凝聚体，并聚焦转录共激活因子，推动脂质与胆固醇的生物合成。在脱髓鞘动物模型中，ESI1 有助于髓鞘的重建，并能在中枢神经系统 (CNS) 轴突上实现从头到尾的髓鞘生成，从而逆转与年龄相关的认知能力衰退。

DNMT1 HDAC-IN-1 (compound (R)-23a) 作为一种针对DNMT1 HDAC的双重抑制剂，具有良好的选择性，其对HDAC1的抑制常数(IC50)为0.05 μM。HDAC1为多个蛋白质复合物中的主要HDAC异构体，能与DNMT1交互作用，参与TSGs的转录沉默。此外，DNMT1 HDAC-IN-1能有效重塑肿瘤免疫微环境并诱导肿瘤退化，逆转癌症特异性的表观遗传异常。

UNC0638 hydrate 作为一种化合物，主要通过选择性抑制G9a和GLP组蛋白甲基转移酶达到其生物活性，其半抑制浓度(IC50)分别为15 nM和19 nM。在体外实验中，此化合物有效抑制TNBC（三阴性乳腺癌）细胞的侵袭与迁移。同时，作为EHMT1 2的抑制剂，它能在人红细胞祖细胞的培养中诱导胎儿血红蛋白(HbF)的表达。此外，UNC0638 hydrate 对FMDV（口蹄疫病毒）和VSV（水疱性口炎病毒）均显示出抗病毒活性，展现了其在多种表观遗传和非表观遗传靶标上的高效力和选择性。

Calcium 2-hydroxypropanoate (pentahydrate) 是羟基羧酸受体 1 (HCAR1) 的激活剂，并诱导赖氨酸残基乳酰化作为表观遗传调节剂。作为糖酵解的终产物，它在糖酵解与氧化磷酸化之间形成桥梁。Calcium 2-hydroxypropanoate (pentahydrate) 也被视为一种肿瘤代谢物，在抗肿瘤免疫中展示乳酸的免疫保护作用。

Oxybenzone-d3 (Benzophenone 3-d3) 是一种氘代标记的Oxybenzone，常用于晒黑产品和皮肤保护剂中的紫外线过滤。Oxybenzone 作为内分泌干扰物质 (EDCs) 能穿透胎盘和血脑屏障，并可能损害自噬 (autophagy)，改变表观遗传状态，还在凋亡神经元细胞中破坏类维生素 X 受体 (retinoid X receptor) 信号传导。

SKLB-03220 是一种口服活性的共价抑制剂，靶向组蛋白甲基转移酶 EZH2，该酶为已知的参与观遗传调控的肿瘤学化合物靶点。SKLB-03220 的结构基于临床批准的 EZH2 抑制剂 tazemetostat，并能够消除表观遗传 H3K27me3 标记，改变染色质状态及转录活性。SKLB-03220 是癌症表观遗传研究中强效的小分子工具化合物。

HM-cytosine (5hmC) (5hmC) 是哺乳动物基因组 DNA 中天然存在的成分，被认为是 DNA 的第六个碱基。HM-cytosine 是活性 DNA 去甲基化的中间代谢物。HM-cytosine 是已知会影响哺乳动物全局基因表达的表观遗传标记。

MS049 2HCl (1502816-23-0(free base)) 是一种有效的选择性 PRMT4 (IC50 = 34 nM) 和 PRMT6 (IC50 = 43 nM) 抑制剂。它对其他 I 型 PRMT 的活性较低（对于 PRMT1、PRMT3 和 PRMT8，IC50分别>130、>220 和 1.6 μM，），并且对 II 型或 III 型 PRMT 没有抑制作用，也没有对任何其他甲基转移酶或非表观遗传靶标进行测试。