表观遗传靶向化合物库

库设计
鉴于表观遗传靶点类别之间的极大差异，我们采用了多种策略来构建该文库。每一类表观遗传靶标都包含多样化的蛋白家族，需分别对待。在创建文库时，核心理念是构建针对特定家族的化合物库，而非仅仅面向单一的分子靶点。这种方法基于以下思路：将来自相似家族的分子靶点，根据其结合位点的信息（包括位点的空间结构、氨基酸组成等）划分为多个簇群，从而使我们能够构建一个描述该靶点家族及其与配体相互作用特异性的综合特征图。这些数据为以下两方面提供了坚实基础：选择最具代表性的中心蛋白结构；以及构建初步的药效团模型，用以过滤掉那些缺乏足够结构特征以表现良好结合能力的化合物。后续步骤包括创建更精细的3D药效团模型，以进一步减少需要进入对接程序的化合物数量。最后是分子对接，并对所得结果进行最终筛选和审查。
针对每个目标类别的化合物库创建均采用结合方法，包含基于配体与基于受体两种策略。其通用流程图可归纳如下：
• 分析所有可获得的结构数据（PDB结构库、文献来源等）
• 药效团模型构建与验证
• 基于相互作用关键位点、限制体积与空间构象要求的进阶药效团搜索
• 分子对接
• 对所得结果进行精细调整与可视化检视
该方法能够构建在早期研究阶段针对探索不足靶点的宝贵工具库，有助于发现对靶点具有高亲和力的化合物，从而为后续的苗头化合物探索步骤奠定坚实基础。在此阶段，研究人员可集中精力提升所得苗头化合物对靶点家族其他成员的特异性。

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。