PI4KIIIbeta-IN-9对PI3KC2γ（IC50约1 μM）、PI3Kα（约2 μM）和PI4KIIIα（约2.6 μM）表现出弱抑制作用，并在高达20 μM的浓度下对PI4K2α、PI4K2β和PI3Kβ的抑制率均<50%。PI4KIIIbeta-IN-9呈新月形状，与PI4KIIIβ的活性位点相吻合，与PI4KIIIβ有广泛接触。此外，PI4KIIIbeta-IN-9还能以IC50为152 nM和1046 nM分别抑制PI3Kδ和PI3Kγ。