2-Aminopurine is a double-stranded RNA-dependent protein kinase, protein kinase R (PKR) inhibitor.

一、利用2-氨基嘌呤进行DNA结构探测
1.溶液配置：2-Aminopurine的使用浓度通常为 0.1–50 μM，具体浓度取决于实验需求和荧光信号的灵敏度要求。
2.材料准备：
1） 2-氨基嘌呤标记的寡核苷酸： 通过固相合成法将2-AP插入到特定的DNA序列中。
2）DNA样本： 含有2-AP的寡核苷酸，可以是单链的，也可以是与互补链杂交后的双链。
3） 荧光光谱仪： 能够检测荧光发射和衰减的设备，通常激发波长在310-320 nm范围内，发射波长在370-380 nm范围内。
3.步骤：
1) 寡核苷酸合成： 在合成过程中将2-AP插入到DNA序列中的预定位置。
2) 样本准备： 准备2-AP标记的DNA溶液，浓度应根据实验需要进行调整。
3) 荧光测量： 在激发波长310-320 nm下，测量荧光强度和衰减（发射波长370-380 nm）。
4) 荧光衰减分析： 分析荧光衰减曲线，探究DNA的堆积、构象变化以及与其他分子的相互作用（如蛋白质或配体）。
二、探测DNA构象变化与结合相互作用
1.材料准备：
(1) 2-AP标记的寡核苷酸： 用于研究DNA的结构变化。
(2) 结合配体/蛋白质： DNA结合蛋白、小分子配体或其他DNA相互作用分子。
(3) 荧光光谱仪： 用于检测适当波长的荧光信号。
2.步骤：
(1) DNA-蛋白质结合： 将2-AP标记的DNA与DNA结合蛋白或配体进行孵育。
(2) 荧光测量： 观察结合或构象变化后荧光强度和衰减的变化。
(3) 数据分析： 通过荧光变化来确定配体结合、DNA的结构转变以及DNA与蛋白质或配体相互作用的动力学。