我们比较了与保护性骨髓基质细胞(BMSCs)共培养与否的初级CLL细胞的转录组，并发现在未受保护的CLL细胞中，氧化磷酸化、线粒体功能和低氧信号传导的失调最为明显，变化在6-8小时达到高峰。部分CLL患者表现出与共培养CLL细胞相似的基因表达特征，并且无进展生存期和总生存期显著更短。为识别阻断BMSCs介导支持的化合物，我们将相关的转录组变化与连通性映射数据库进行比较。发现与心脏苷苏木霉素和吐根生物碱emetine及Cephaeline的转录组标志物相关。这些化合物对受保护的初级CLL细胞具有高活性(相对IC50分别为287、190和35 nM)，其作用机制是通过抑制HIF-1α±和扰乱细胞内氧化还原平衡。我们在CLL的鼠模型中测试了emetine，观察到外周血、脾脏和骨髓中CLL细胞减少，血液参数恢复，并且中位生存期加倍（31.5 vs. 15天，P = 0.0001）。