EDANS sodium (5-(2-Aminoethylamino)-1-naphthalenesulfonic acid sodium salt) is a donor for developing FRET-based nucleic acid probes that is widely used in real time PCR assays.

EDANS sodium salt i 的水溶性远高于EDANS酸。它是开发基于FRET的蛋白酶底物和核酸探针中最受欢迎的供体之一。在基于FRET的探针中，EDANS常与DABSYL或DABCYL配对使用。其荧光特性对环境敏感。

使用方法
一、试剂准备：
1.母液和工作液的配置：用适当的溶剂（如水、PBS）溶解，浓度通常在10-100 µM范围，具体浓度取决于实验需要。
2.探针合成：在开发FRET探针时，EDANS可以作为供体与特定的接受体染料配对。探针的合成通常是通过将EDANS与目标DNA或RNA序列连接来完成。
二、操作步骤
1.PCR反应：
1） 探针设计：基于FRET的探针通常包含供体（EDANS）和接受体染料（如TAMRA、BHQ等）。探针的设计需确保EDANS和接受体间的距离适宜，以优化能量转移。
2） PCR反应：将合成的FRET探针添加到实时PCR反应中，配合DNA聚合酶、dNTPs、模板DNA和引物进行反应。探针会在PCR扩增过程中结合到特定目标序列。
3. 荧光检测：在PCR过程中，供体染料（EDANS）通过激发将能量转移到接受体染料，导致荧光信号的变化，实时监测PCR反应的进程。
4. 数据分析：使用实时PCR仪器（如荧光定量PCR仪）监测荧光信号变化，计算目标DNA或RNA的浓度。
注意事项：
1.探针优化：选择合适的FRET对（供体和接受体）是成功的关键，确保它们的光谱特性互补，以实现最佳的能量转移。
2.溶解性：EDANS sodium的溶解性较好，但使用时要避免过度暴露在强光下，以防荧光漂白。