endonuclease

PFM39 是一种选择性 MRE11 核酸外切酶抑制剂，是 Mirin 类似物，可延长有丝分裂。PFM39 抑制 HR，可缓解由 EXO1/BLM 耗竭引起的修复缺陷。

PFM01 是 MRE11核酸内切酶抑制剂，是 N-烷基化的 Mirin 衍生物。它可以通过非同源末端连接 (NHEJ) 和同源重组 (HR) 调节双链断裂修复 (DSBR)。

EndonucleaseIV 是一种 DNA 修复酶，属于脱嘌呤/脱嘧啶 (AP) 核酸内切酶。它具有针对 AP 位点的核酸内切酶活性，并具有 3' 磷酸二酯酶活性，能够去除 DNA 3' 端的各种连接阻断损伤。此外，EndonucleaseIV 对氧化性 DNA 损伤也有核酸内切酶活性，并具有 3' 至 5' 外切酶活性。

T4endonucleaseVII 展现了广泛的底物特异性，能够结合并切割 DNA 双链体，以及三向和四向分支 DNA 结构中的单碱基错配。

PFM03是一种特异性阻断Mre11的内切酶抑制剂，还能够降低98%的MRN内切酶活性，阻断hMRN介导的蛋白结合端5 ‘和3 ’链上的内切切口和核外溶过程。

PNR-3-80 是一种选择性 EndoG 抑制剂，其对 EndoG 的 IC50 值为 0.67 μM，优于对 DNase I 的抑制。PNR-3-80 对 DNase II、RNase A、蛋白酶、乳酸脱氢酶以及超氧化物歧化酶 1 无抑制作用。它展现出显著的细胞保护活性，能够有效保护人前列腺癌细胞不受 Cisplatin 和 Docetaxel 引发的细胞死亡影响，并抑制 Etoposide 引起的 DNA 损伤和自噬 (autophagy)。PNR-3-80 适用于细胞损伤的研究。

FEN1-IN-SC13 是有效的DNA 片段化核酸内切酶 1 抑制剂。

T5 Exonuclease 是一种具有 5′-3′ 核酸外切酶活性的 DNA 核酸外切酶，适用于单链和双链 DNA。此外，T5 Exonuclease 还具备单链内切酶和 5′-flap 内切酶的功能。

MU147 是一种具有抗癌活性的 MRE11 核酸酶抑制剂和化学探针，对体内外的 Ehrlich 腹水肿瘤细胞具有致死性。MU147 消除依赖于 MRE11 核酸酶活性的双链断裂修复机制，而不影响 ATM 的激活。它还损害停滞复制 FOX 的新生链降解，并选择性影响 brca2 缺陷细胞。

MU1409 是一种MRE11核酸酶抑制剂，其IC50为12.1 μM。除此之外，MU1409 对FEN1和EXO1也有抑制作用，IC50分别为24.2 μM和176.4 μM。MU1409 能影响细胞内DNA修复，阻止BRCA2缺陷细胞中停滞复制叉的降解，这为BRCA2突变相关的癌症研究提供了潜力。

O-Glycoprotease 是一种特异水解 O-糖蛋白的内切蛋白酶，能够催化天然黏蛋白型 O-糖基化蛋白中紧邻 O-聚体的肽键。该酶的序列源自 Akkermansia muciniphila，重组表达于 E.coli，并带有 C 端 6×His 标签。其在 pH 5.5-7.5 之间保持高活性，耐受 1 M NaCl，但对 0.5 mM EDTA 高度敏感，并受 Zn2+ 抑制。

Cyclic tri-AMP 是环状寡核苷酸抗噬菌体信号系统 (CBASS) 中的重要成分，在应对病毒感染的免疫反应中，它作为第二信使发挥作用。它与 DNA 核酸内切酶 NucC 结合并激活该酶，从而导致细胞死亡并产生抗病毒效果。

AD16 (Acetamide) 是一种 LINE-1 逆转录转座子内切酶 (LINE-1 retrotransposon endonuclease) 的抑制剂，IC50 值为 4.7 μM。AD16 (Acetamide) 能减少衰老细胞中的 LINE-1 逆转录以及由其引发的 DNA 损伤和炎症。

Deoxyribonuclease II from porcine spleen(DNase II)是一种主要位于溶酶体中的核酸内切酶，在5'-磷酸和3'-羟基之间切割DNA的磷酸二酯鍵，降解外源DNA并产生核苷-3'-磷酸。

dsDNase是一种高度特异的双链DNA (dsDNA) 内切酶，能够快速且有效地去除PCR主混合物中的污染DNA。

MUS81-IN-1 (compound 23) 是一种MUS81的抑制剂，可应用于癌症研究。

Cap-dependent endonuclease-IN-1 是一种具有高效性和口服活性的帽依赖内切酶抑制剂，具有抗病毒活性，可用于研究流感病毒感染。

Baloxavir (S-033447) 是衍生自前药 Baloxavir marboxil，是流感病毒聚合酶 PA 亚基的一流帽依赖性核酸内切酶抑制剂。它抑制病毒 RNA 的转录和复制，具有强大的抗病毒活性。

CRT0044876 (7-NO2-ICA) 是一种高选择性的嘌呤/嘧啶核苷核酸内切酶 1 抑制剂，IC50约为 3 μM。它也是 APE1 所属的核酸外切酶 III 家族的特异性抑制剂，可抑制 APE1 的 AP 内切酶、3′-磷酸二酯酶和 3′-磷酸酶活性，可增强几种 DNA 碱基靶向化合物的细胞毒性。

ERCC1-XPF-IN-2 在核苷酸切除修复、顺铂增强和 γH2AX 测定中具有活性。ERCC1-XPF-IN-2 是 ERCC1-XPF 核酸内切酶的有效抑制剂，IC50值为 0.6 μM。

E3330 是一种口服有效的选择性 AP 内切核酸酶 1 (APE1; REF-1) 抑制剂，可抑制NF-κB DNA 结合活性。它阻断 TNF-α 诱导的肝癌细胞系中 IL-8 的激活，可以抑制癌细胞的生长和迁移，具有抗癌活性。

FEN1-IN-4 (FEN1 Inhibitor C2) 是人类皮瓣内切核酸酶-1 (hFEN1) 抑制剂。

Cap-dependent endonuclease-IN-27 (Compound 8) 是一种口服活性的 cap-dependent 核酸内切酶 (CEN) 抑制剂，具有抗乙型流感病毒的特性。它作为抗病毒剂对 IFV A/WSN/33 (H1N1) 聚合酶显示出抑制活性 (EC50= 12.26 nM)。

PAN endonuclease-IN-2 (compound T-31) 为PAN核酸内切酶抑制剂 (IC50: 0.15 μM) 和抗病毒剂，展现出广谱抗流感活性。PAN 是聚合酶-RNA 复合物中PA 亚基的N 端，与依赖性核酸内切酶 (CEN) 活性位点有关。通过促进RNA链的裂解并启动聚合酶合成新的RNA分子，PAN 发起RNA复制。PAN endonuclease-IN-2 有效靶向流感HA和RdRp复合物，从而干扰病毒进入宿主细胞及其复制过程。