BACE-1/Mpro-IN-1 (Compound 6c) (0-0.52 μM) 能与 BACE1 的活性位点及变构口袋相互作用，从而降低 Vmax 并增加 Km，削弱底物亲和力。该化合物与 Asp228 和 Arg235 位点形成 π-硫结合，同时与 Thr72、Asn233 和 Lys224 位点形成亲水氢键，与 Tyr71 和 Tyr198 位点产生疏水 π-π 相互作用。BACE-1/Mpro-IN-1 的喹啉部分与 S1 亚口袋附近的 Cys145 之间的 π-硫相互作用显著。在 S1’部位，Met49 和 Cys145 与化合物的苯甲醚和喹啉部分形成 π-硫相互作用；而在 S2 部位，His41 与苯部分表现出 π-π 堆积作用，Gln189 则能形成氢键及 π-烷基相互作用。在 S3 部位，Met165、Ala191 和 Arg188 参与了 π-烷基与 π-π 堆积作用。BACE-1/Mpro-IN-1 (0-100μM) 的结合能为 −7.6 kcal/mol，显示出其抑制 Mpro 的潜力。此外，通过平行人工膜通透性试验证明了其对血脑屏障的高渗透性，其通透性 (PAMPA-BBB) P e(tested) (10 −6 cm/s) 达到 12.74。

BACE-1/Mpro-IN-1 (50-750 mg/kg) 在低至中等剂量 (≤ 150 mg/kg BW) 时安全性良好，但在高剂量 (≥ 350 mg/kg BW) 对瑞士白化小鼠显示出明显毒性。