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Protein-protein interactions (PPI) inhibitor library iPPI Tree
iPPI Tree Library 是一个包含1211种化合物的库,它是使用决策树算法基于多个分子形状和功能团描述符设计的。该算法有效地将化合物分为PPI 抑制剂和非PPI 抑制剂两类[1]。根据基于RDF070m 和Ui 描述符的另一个模型,这个小型库中超过99%的化合物被检测为潜在的PPI 抑制剂。
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针对蛋白质相互作用(PPI)的药物研发是当前的一个新挑战。鉴于对PPI抑制剂的兴趣不断增长,OTAVAchemicals提供了覆盖PPI抑制剂化学空间的靶向化合物库。这些iPPI专注库是根据最近发表的PPI抑制剂模型和相似性搜索进行筛选的化合物。其中包括iPPI Tree Library(1211个化合物)和iPPI Bayesian Library(2637个化合物)。这些库经过Lipinski规则的筛选,但同时考虑了已知PPI抑制剂的较高分子量(MW)和LogP值。MW的限制范围设置在300到700 Da之间,LogP值设置在1到6之间。氢键受体数量介于0到10之间,氢键供体数量为0到5。此外,这两个库中剔除了具有反应性基团和多效抑制剂的化合物。
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