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产品描述
图1. 激酶催化蛋白质磷酸化过程（A），磷酸酶则催化其去磷酸化过程（B）。该图引自Seok于2011年发表的研究。
磷酸酶聚焦库 - 第一部分
（基于ChEBI-DB、PubChem、DrugBank数据库的相似性筛选）
我们采用12,516种已知生物活性化合物（PubChem活性数据IC50等≤1µM）作为参考集进行相似性筛选，这些化合物在88项实验中均被证实对以下59种磷酸酶相关靶点具有活性（数据来源：ChEBI-DB、PubChem、DrugBank数据库）。
- Acid phosphatase (Class B, ACP1, Purple)
- ADP-sugar pyrophosphatase
- Alkaline phosphatase (tissue-nonspecific isozyme, placental-like, ALPL, intestinal alkaline phosphatase)
- Aspartate Phosphatase F
- CTD small phosphatase 1
- dCTP pyrophosphatase (DCTPP1, ASMTL)
- Dual Specificity Phosphatase (CDC25 type A/B/C, PTEN, DUSP3)
- Inositol monophosphatase
- Inositol-1-phosphatase
- Lipid-phosphate phosphatase
- Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase (ACP1, ets.)
- PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 1
- Myosin light chain phosphatase
- Phos Phosphatase Ahk4
- Phosphoethanolamine/phosphocholine phosphatase
- Phosphotyrosine-protein phosphatase PTPB
- Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type (SHP2, PTPN1, PTP1C, PTP2C, PTP4A3, LC-PTP, PTPN1, PTPN1, PTPN2, PTPN11, PTPN22, PTPN6, 70Z-PEP)
- Protein-tyrosine phosphatase receptor type (PTPRA, PTPRC, PTPRD, PTPRE, PTPRF, PTPRO, PTPRS)
- Protein-tyrosine phosphatase YopH
- Pyridoxine 5'-phosphate phosphatase
- Serine/threonine-protein phosphatase (PP1, PP2A, PP5, PP2C Abi1, PP2C HAB1, PP2C PH domain, PP1 Regulatory Subunit 71)
- Undecaprenyl pyrophosphate phosphatase
对内部数据库进行了基于MDL公共分子标识符的相似性检索，以参考数据库中的化合物为模板，采用塔尼莫托相似性系数85%作为筛选阈值（图2）。所有入选化合物均遵循类药五原则，并排除具有反应活性、毒性或PAINS（泛活性干扰化合物）特征的分子。最终筛选出450余个类药化合物加入筛选库。
图2. 基于参考化合物集筛选的磷酸酶筛选库典型代表类似物示例。
磷酸酶聚焦化合物库 - 第二部分
（基于ChEMBL数据库的相似性筛选）
根据ChEMBL数据库条目，我们以3,395个已报道的独特磷酸酶抑制剂构建了化合物参考集，筛选标准采用公认的最大活性值（IC50 < 1 uM）。随后使用Sybyl-X的Unity模块生成的二维指纹进行相似性筛选（塔尼莫托相似度阈值设为85%）。
通过该方法，我们从以下磷酸酶靶点的已知结合剂中识别出近6,750个密切类似物，并将其纳入筛选集合：
- Alkaline phosphatase placental-like
- Alkaline phosphatase tissue-nonspecific isozyme
- Autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN
- CAI-1 autoinducer sensor kinase/phosphatase CqsS
- Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1
- Dual specificity phosphatase Cdc25A and Cdc25B
- Dual specificity protein phosphatase 3
- Dual specificity protein phosphatase 6
- Hematopoietic cell protein-tyrosine phosphatase 70Z-PEP
- Inositol monophosphatase 1
- Intestinal alkaline phosphatase
- Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase
- PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 1
- Phosphoethanolamine/phosphocholine phosphatase
- Phosphotyrosine-protein phosphatase PTPB
- Protein-tyrosine phosphatase 1B
- Protein-tyrosine phosphatase 1C
- Protein-tyrosine phosphatase 2C
- Protein-tyrosine phosphatase LC-PTP
- Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O
- Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta
- T-cell protein-tyrosine phosphatase
包装和储存
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