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研究采用PDB编号3BV2记录的p38 MAPK结构进行分子对接分析,使用DOCK4.0-6.0程序完成对接计算与结果解析。蛋白质结构制备与分子动力学模拟通过GROMACS软件实现,配体分子则经由GAMESS和GROMACS处理。对接过程的关键特征与约束条件基于蛋白质结合口袋的以下关键残基确定:Met109、Glu110、Asp168、Glu71、Lys53构成供体/受体位点;Thr106、Phe169、Leu74、Leu75、Val30、Leu171、Leu108负责疏水相互作用(图1)。
通过对符合类药五原则和韦伯规则的化合物进行预筛选,最终鉴定出1100余种潜在MAP激酶抑制剂。








































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