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蛋白质折叠在新药开发中是一个非常重要且具有吸引力的领域。通过分子伴侣这类酶的作用,细胞可以控制这些过程。这一多样的蛋白质家族协助了许多涉及蛋白质在细胞环境中的折叠、转位、解聚、去聚集和稳态调节等过程。尽管进行了大量的研究,这些不同伴侣蛋白介导的细胞底物和功能的范围仍然大部分未定义。与此同时,针对分子伴侣的靶向治疗被证明对预防蛋白质错位和聚集所导致的许多有害效应至关重要,这些效应可能导致细胞死亡、神经退行性疾病和其他蛋白质错位性疾病。
库设计:
- 基于配体的方法:药效团搜索、生物等排取代、基于三维形状的筛选。
- 基于蛋白质/靶向的方法:分子对接、基于蛋白质-配体关键相互作用特征的体外筛选。
- 严格的MedChem过滤器,包括PAINS和其他行业相关的结构过滤器和规则。
针对上述靶点收集到的报道活性分子集进行了仔细分析。在体积限制约束下创建了一系列三维药效团模型,并使用参考活性和非活性配体集对其进行进一步验证。然后,将Enamine的MedChem库化合物集合(符合Ro5标准并通过一系列MedChem过滤器进行了筛选)与这些模型进行筛选。结果进行了视觉检查,并移除了来源于常见化学类型以及与药效团模型匹配程度较差的分子。还通过核心结构的生物等排替代和特权基团的化合物选择来丰富该库,以获取新的有价值的结构和潜在的药物/前药样化合物。