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产品描述
图1. 涉及基质金属蛋白酶的癌症类型及化合物库中抑制这些酶的化合物。
图2. 涉及基质金属蛋白酶的各种病理及化合物库中抑制该酶的化合物。
背景信息
基质金属蛋白酶存在于所有生物界中，属于金属蛋白酶的metzincin超家族，其特征是活性中心含有一个催化锌原子。目前已鉴定出至少25种不同的脊椎动物MMP，其中24种存在于人体内，包括：胶原酶（MMP-1、8、13）、明胶酶（MMP-2、9）、膜型MMP（MMP-14、15、16、17、24、25）、基质裂解素（MMP-3、10、11）、matrilysin（MMP-7、26）以及其他类型（MMP-12、19-21、23A/B、27、28）。
过去20年间，研究发现MMP还具有多种细胞内功能。细胞内MMP参与多种疾病的发病机制，如心血管疾病、肾脏疾病、炎症和恶性肿瘤。它们还具有抗病毒和杀菌作用。需要指出的是，MMP可通过蛋白酶依赖性和非蛋白酶依赖性两种机制在细胞内发挥作用。
化合物筛选
最初，从CHEMBL数据库中获取了约30,000种已知具有MMP抑制活性的参考化合物。通过过滤，仅保留对MMP具有中高活性的化合物，将范围缩小至7,085种。随后，使用二维分子指纹和两种相似性指标（Tanimoto系数 > 0.75），在内部数据库中对参考集进行相似性搜索。接着，应用Lipinski五规则筛选类药化合物，并剔除PAINS化合物及含有"不良"或反应性基团的分子。
Matrix Metalloproteinase靶向化合物库包含超过3,100种筛选化合物，预计对以下靶点具有活性：
- 1,2-dihydroxy-3-keto-5- methylthiopentene dioxygenase
- 72 kDa type IV collagenase
- ADAMTS5
- Collagenase
- Collagenase 3
- Matrix metalloproteinase 1
- Matrix metalloproteinase 2
- Matrix metalloproteinase 3
- Matrix metalloproteinase 9
- Matrix metalloproteinase 11
- Matrix metalloproteinase 12
- Matrix metalloproteinase 13
- Matrix metalloproteinase 14
- Matrix metalloproteinase 15
图3. 基于参考化合物集从基质金属蛋白酶聚焦库中选取的代表性分子示例。
包装和储存
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