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产品描述化合物筛选
首先，从CHEMBL数据库获取了包含23,174个具有已知连接酶抑制活性的参考化合物集合。通过筛选保留仅对连接酶靶标具有中高活性的化合物，进一步过滤后得到包含10,000个独特连接酶调节剂的12,000条活性数据。
随后，以参考集合为基础对内部数据库进行二维指纹相似性搜索（塔尼莫托系数>0.85，每个参考化合物最多匹配50个类似物）。此外，最终筛选库中移除了含高反应性基团的分子，使其成为针对连接酶药物研发项目的优质新化学结构来源。
本次搜索涵盖以下连接酶靶点（图1）：
- Proline-tRNA ligase
- Lysine-tRNA ligase
- Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N
- Tumour suppressor p53/oncoprotein Mdm2
- E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33
- E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
- Acetyl-CoA carboxylase
- Lysine--tRNA ligase
- Inhibitor of apoptosis protein 3
- Acetyl-CoA carboxylase 2
- MDM2-MDMX
- p53-binding protein Mdm-2
- Pantothenate synthetase
- Acyl-CoA synthase
- Prolyl-tRNA synthetase
- Methionyl-tRNA synthetase
- Acetyl-CoA carboxylase 2
- Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain
- SUMO E1/E2
- DNA ligase 1
- Proline--tRNA ligase
- Transcription intermediary factor 1-alpha
- Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic
- UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D-alanine ligase
- E3 ubiquitin-protein ligase
- E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91
- Lysyl-tRNA synthetase
- E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4
- E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1 or NEDD4
- NH(3)-dependent NAD(+) synthetase
- UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamyl-lysine-D-alanyl-D-alanine ligase
图1. 库中按通用靶点类别划分的化合物分布
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