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化合物筛选方法
我们内部基于受体的高通量虚拟筛选方法采用多步骤联合筛选策略,包括:类药性过滤、分子对接、重打分、关键分子间氢键与疏水相互作用检测,以及最终的配体-受体复合物视觉验证。通过已报道活性数据的激酶抑制剂参考化合物集,我们对蛋白结合位点模型与对接流程进行了验证。随后针对特定蛋白激酶靶点的蛋白-配体复合物晶体三维结构开展高通量虚拟筛选,并应用内部药物化学过滤器(PAINS、毒性分子、反应性分子),最终筛选出具有潜在激酶抑制活性的类药性筛选化合物。
各筛选化合物库详细信息如下:
激酶II型抑制剂筛选库
3-磷酸肌醇依赖性激酶-1(PDK1)靶向库
AKT丝氨酸/苏氨酸激酶靶向库
ALK酪氨酸激酶聚焦库
极光激酶A靶向库
极光激酶B靶向库
环磷腺苷依赖性蛋白激酶(PKA)靶向库
c-Met(HGFR)激酶靶向库
细胞周期蛋白依赖性激酶筛选库
甘油二酯激酶(DGK)靶向库
表皮生长因子受体(EGFR)激酶靶向库
ERK5(MAPK7)激酶靶向库
Fes/c-Fes酪氨酸蛋白激酶靶向库
糖原合成酶激酶3(GSK3)靶向库
成纤维细胞生长因子受体1酪氨酸激酶靶向库
Janus激酶(JAK)靶向库
p38丝裂原活化蛋白(MAP)激酶聚焦库
磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)靶向库
ROCK激酶靶向库
SRC家族激酶(SFK)靶向库
血管内皮生长因子受体激酶2(VGFR-2)聚焦库





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