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库设计
根据文献资料,IDO抑制剂与生物靶点的关键相互作用是通过与活性位点血红素中的铁离子配位来实现的。正是这种相互作用阻止了铁离子参与吲哚胺的氧化过程。
大量已知的IDO抑制剂是亲水性化合物,且分子量相对较低。因此,在初始化合物集筛选中,我们应用了严格的物理化学参数过滤器(类先导性、Veber规则)。我们开发了一套全面的文库设计方法,该方法融合了基于配体/受体的虚拟筛选、血红素结合片段的富集以及新化学型的选择。
• 基于配体的方法:从我们的库存化合物中挑选出具有相似骨架、化学型及关键官能团的化合物。
• 分子对接:在血红素配位约束及对大多数强效配体至关重要的其他结构特征的条件下进行虚拟筛选。优先考虑配体填充周围次级口袋的能力。
• 基于子结构搜索的选择:严格筛选文献报道中可与血红素形成配位键的片段结构。将具有独特化学型和合适构象的化合物纳入文库。
• 分子属性:100%符合"类药五原则",99.5%具备类先导性。
分子示例
库中包含的螯合片段及所用参考化合物的示例





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