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产品描述内源性逆转录病毒K组成员7前体蛋白（VPK7）
近期研究表明，老年人内源性逆转录病毒K组成员7前体蛋白（VPK7）表达增加与脱氢表雄酮水平降低、皮质醇水平升高存在关联。这种激素比例的变化会加剧老年慢性疾病患者的炎症风险。部分VPK7表达降低的患者显示慢性疾病症状缓解，因此有必要深入探究VPK7对老年慢性病患者激素水平的影响。已知该蛋白存在于部分胎盘样本、肿瘤形成组织以及HIV感染者的脑组织中，针对该蛋白的进一步研究将具有多领域的临床价值。
化合物筛选
我们首先通过BLAST工具比对两条序列，识别可能反映功能与结构关联的相似区域（图1）。虽然不同同源物显示出显著相似性，但目前尚无实验确定的蛋白结构报道。因此，我们采用三种不同的计算机模型进行分子对接分析。
图1. 两条序列（完整的UniProtKB/P63131序列与查询序列）的成对序列比对
优先选取UniProt数据库中的AlphaFold模型，同时从SWISS-MODEL（QMEANDisCo全局评分：0.58 ± 0.06）和I-TASSER工具获取了VPK7蛋白第9-117位氨基酸残基的全原子结构。模型质量通过MolProbity进行评估：Clashscore指标显示所有原子的数值分别为AlphaFold=2.07、SWISS-MODEL=2.4、I-TASSER=13.61。Ramachandran分析表明，AlphaFold模型有94.2%的残基处于最优区域，100.0%处于允许区域；SWISS-MODEL模型有98.1%的残基处于最优区域，100.0%处于允许区域；I-TASSER模型有66.0%的残基处于最优区域，89.5%处于允许区域。
对每个模型进行了潜在活性位点预测，并确定了包含DTG催化基序的活性位点。在受体网格生成过程中，将I-TASSER和SWISS-MODEL模型的D34氨基酸残基（对应AlphaFold模型的D26位点）设定为氢键供体约束条件。
图2. 所得模型的结构比对（绿色–SWISS-MODEL，蓝色–AlphaFold，黄色–I-TASSER，粉色–DTG催化基序）
采用基于分子对接的虚拟筛选方案（薛定谔公司的Glide软件，SP模式），对内部数据库进行筛选以寻找潜在的VPK7活性位点结合剂。未设置任何对接约束条件，以便让对接算法能够探索尽可能多的配体位置与取向。
对筛选得到的化合物库进行交叉比对后，仅保留能与全部三种蛋白模型发生相互作用的化合物，并进一步应用内部MedChem过滤器及PAINS结构过滤器进行筛选。
核心参数：
• 方法：高通量虚拟筛选（分子对接）
• 使用的X射线数据：不适用
• 约束条件：DTG相互作用位点
• 应用过滤器：PAINS过滤器、毒性过滤器、反应活性过滤器
• 筛选化合物数量：700个
图3. 化合物F6521-6618在hERV-K结合位点的结合模式（对接得分 = -9.149）。配体的氨基和亚氨基基团与Ser11、Thr35及Thr113氨基酸残基形成氢键。
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