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化合物筛选
基于A6NDG6序列的人源PGP蛋白结构通过AlphaFold、Robetta和I-TASSER进行重构(图1)。采用MolProbity评估各模型质量。针对三个模型的五个活性位点分别构建对接位点,并在所有位点完成分子对接(图2)。通过"分位点"策略获得的化合物集合与模型化合物整合后进行交叉比对(图3)。使用薛定谔软件中的QikProp模块根据化合物属性与描述符对结果库进行精简。
最终筛选出2000余个具有类药性的独特分子作为潜在PGP抑制剂,纳入该筛选化合物库。





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