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甘油-3-磷酸磷酸酶PGP靶向库现货

Glycerol-3-phosphate Phosphatase PGP Targeted Library

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产品编号 LF1036

3-磷酸甘油磷酸酶(G3PP/PGP)是新近发现的一种处于代谢核心环节的酶。它属于卤酸脱卤酶样水解酶超家族,参与葡萄糖、脂质和能量代谢过程。PGP能催化上述代谢过程的中间产物3-磷酸甘油发生水解反应生成甘油,从而调控细胞内3-磷酸甘油水平。
PGP在代谢性疾病发生发展中可能具有关键作用,尤其在与心脏代谢疾病相关的2型糖尿病和肥胖症中。该酶在胰腺β细胞中的活性可降低胰岛素水平,预防导致β细胞耗竭及后续损伤的高胰岛素血症;在肝脏中,PGP水平升高能促进脂肪酸氧化并减少葡萄糖生成,对2型糖尿病和肥胖患者产生积极影响;对于糖尿病心肌病和心力衰竭患者,PGP能抑制心肌中过度的脂肪堆积。因此,PGP/G3PP被视为开发针对年龄相关性代谢疾病及3-磷酸甘油裂解相关脂代谢紊乱的新型药物的潜力靶点。目前由于缺乏该磷酸酶的空间结构晶体学数据,尚未出现靶向PGP的活性小分子相关报道。
为顺应药物研发领域的当前趋势与前沿方向,本计算化学团队成功构建了包含2000余种结构多样性小分子的独特筛选化合物库——3-磷酸甘油磷酸酶调节剂专用库。项目通过从头重构蛋白空间结构、预测结合位点并进行分子对接筛选,采用Maestro软件的QikProp描述符进行结构过滤,并运用内部药物化学规则、ADME参数及PAINS过滤标准,最终确保所有入库化合物均符合类药性要求。

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产品编号 LF1036

甘油-3-磷酸磷酸酶PGP靶向库

规格

  • 30 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 50 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 250 μL x 10 mM (in DMSO)
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产品描述 产品描述

化合物筛选
基于A6NDG6序列的人源PGP蛋白结构通过AlphaFold、Robetta和I-TASSER进行重构(图1)。采用MolProbity评估各模型质量。针对三个模型的五个活性位点分别构建对接位点,并在所有位点完成分子对接(图2)。通过"分位点"策略获得的化合物集合与模型化合物整合后进行交叉比对(图3)。使用薛定谔软件中的QikProp模块根据化合物属性与描述符对结果库进行精简。
最终筛选出2000余个具有类药性的独特分子作为潜在PGP抑制剂,纳入该筛选化合物库。

 Glycerol-3-phosphate Phosphatase PGP Targeted Library
图1. 基于A6NDG6序列的人源PGP蛋白结构重建:获得模型的构象比对(绿色-Robetta重建模型,蓝色-AlphaFold重建模型,黄色-I-TASSER重建模型)。
 Glycerol-3-phosphate Phosphatase PGP Targeted Library
图2. PGP蛋白表面的结合位点。
 Glycerol-3-phosphate Phosphatase PGP Targeted Library
图3. Robetta模型位点1中的化合物(F6436-3707)。该复合物通过分子对接获得。

包装和储存 包装和储存

  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

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