半胱氨酸蛋白酶靶向化合物库

半胱氨酸蛋白酶靶向化合物库

Cysteine Protease Focused Library

很棒

产品编号 LF6500

半胱氨酸蛋白酶是生物学上最重要的蛋白质簇之一，参与多种细胞通路。它们涉及免疫逃逸、寄生虫入侵、寄生虫逸出、水解作用及细胞外基质代谢等多个生物学过程，这使其成为多种疾病（如艾滋病、癌症、心脑血管疾病与炎症性疾病、血栓、呼吸系统疾病、胰腺炎及神经系统疾病）的潜在药物靶点。
该蛋白酶家族可划分为14个超家族，虽存在结构差异，但具有共同的作用机制。其在蛋白质降解中的独特功能决定了半胱氨酸蛋白酶在生物体内的广泛分布。由于靶标折叠特异性导致的活性位点多样性，该类蛋白酶常被含有亲电弹头（如环氧化物或乙烯基砜）的化合物靶向，这些化合物通过模拟靶标酶的肽底物与活性中心的催化残基发生特异性相互作用。

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该筛选库共包含约9200种具有潜在半胱氨酸蛋白酶抑制活性的类药物筛选化合物（图1-2）。

Human rhinovirus A protease
Cruzipain
Cathepsin B
Cathepsin K
Cathepsin L
Papain
Cathepsin S
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1
Caspase-3
Calpain 1
Caspase-6
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2
Sentrin-specific protease 7
Caspase-8
Caspase-7
Sentrin-specific protease 8
Sentrin-specific protease 1
Sentrin-specific protease 6
Cysteine protease ATG4B
Genome polyprotein
Calpain 2
Caspase-1

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14
Protease
Dipeptidyl peptidase I
Caspase-10
Cathepsin L2
Peptidase 1
Hepatitis C virus polyprotein
Calpain small subunit 1
Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X
Sortase A
Cathepsin F
Rhodesain
Falcipain 2
Cathepsin H
Cysteine protease falcipain-3
Caspase-9
Legumain
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
Caspase-2
Cysteine protease falcipain-2
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28
Caspase-14
Caspase-5

Poliovirus type 1 polyprotein
Trophozoite cysteine proteinase
Cathepsin B-like cysteine protease
Cysteine proteinase B
Gamma-glutamyl hydrolase
Caspase-4
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1/WD repeat-containing protein 48
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47
Calpain 1/2
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3
Falcipain 2B
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5
Caspase
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4
Caspase-3/Caspase-7
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8
Cysteine proteinase falcipain-1
Probable cathepsin C
Sentrin-specific protease 2
Cysteine proteinase 1
Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18

本化合物库的设计采用二维指纹相似性搜索方法。我们基于专利和文献数据，构建了包含15,000多个半胱氨酸蛋白酶相关生物活性化合物的参考数据库。通过MDL公开密钥和塔尼莫托相似度大于85%的标准，从内部数据库中筛选出具有实验验证活性的小分子类似物。需要说明的是，由于以半胱氨酸蛋白酶为靶点的药物特性，若应用PAINS过滤器会同时剔除大量参考分子和类似筛选化合物，因此本库构建未采用该过滤方案。活性化合物的剔除则通过内部MedChem过滤器实现。