Caspase靶向化合物库

背景信息
在急性（心肌梗死、中风、败血症）和慢性（神经退行性疾病，特别是阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）状态下，细胞损伤部位常观察到细胞凋亡水平和半胱天冬酶活性升高。炎症性半胱天冬酶在调节炎症及炎症性疾病（如银屑病、关节炎、败血症等）中起关键作用。炎症与细胞死亡也是许多代谢性疾病（如肥胖症、糖尿病和肝病）发病机制的核心因素。因此，半胱天冬酶成为治疗神经退行性疾病、代谢紊乱、癌症及炎症的重要靶点。

所有半胱天冬酶均具有若干共同特征：包括由活性位点Cys285（保守QACXG五肽序列组成部分）、His237及177位残基骨架羰基（按半胱天冬酶-1编号）构成的催化三联体；其最显著特性是能特异性切割天冬氨酸残基后的底物，这一特性在哺乳动物蛋白酶中独一无二。

首先筛选出一组与对应蛋白质共结晶的强效 caspase 抑制剂作为参考集，并基于配体的晶体学构象建立查询特征。随后使用 TopomerSearch（SYBYL-X）工具对预选的筛选化合物库进行扫描，最终通过内部 MedChem 和 PAINS 过滤器排除具有非预期结构的化合物。
研究共识别出 2,800 余个潜在 caspase 调节剂，主要聚焦于细胞凋亡信号通路中的关键靶点（对应 PDB 条目标注于括号内）：

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。