水通道蛋白筛选化合物库

水通道蛋白筛选化合物库

Aquaporin Screening Library

很棒

产品编号 LF2100

水通道蛋白是促进水分子跨细胞膜传输的整合膜蛋白。这类通道能选择性引导水分子进出细胞，同时阻止离子及其他溶质通过。水通道蛋白在维持体液平衡、肾脏功能、细胞迁移等多种生理过程中发挥关键作用。由于与多种疾病相关，水通道蛋白已成为重要的治疗靶点。
调控水通道蛋白功能为治疗水肿、脑肿胀及肾脏疾病等水平衡紊乱相关病症提供了潜在途径。药物研发致力于通过增强或抑制其活性来实现选择性调控，从而针对特定疾病状态进行干预。目前已报道的乙酰唑胺、唑尼沙胺、布美他尼、AQB-013、阿比多尔和柽柳黄素等抑制剂对水通道蛋白1、4、5亚型显示出高活性（图1）。
我们采用基于受体的研发策略，精心构建了专业的水通道蛋白靶向化合物库，包含2,000余种小分子筛选化合物，为聚焦水通道蛋白的药物发现项目提供支持。

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图1. 已知水通道蛋白抑制剂AQB013（左）、阿比多尔（中）和柽柳素（右）在水通道蛋白4结合位点的对接构象。图中标明了预测与配体原子形成供体/受体相互作用的原子区域及疏水核心区。

化合物筛选
本筛选集的构建主要针对结合位点3和位点1。为界定水通道蛋白可能的配体结合位点，我们采用FTMap在线服务器进行结合位点搜索。该工具可通过分子探针（小分子或官能团）在蛋白空腔内的空间分布可视化及表面溶剂映射分析，以重叠的分子探针簇区域标识潜在结合位点。

随后我们采用柔性对接方法Flexible Glide为水通道蛋白1、4、5制备对接网格并设定约束条件，基于这些网格对内部数据库进行配体筛选。接着对三个配体结合位点进行预处理以适配测试化合物的对接，在SYBYL-X中对对接构象的配体及接触距离内的氨基酸进行能量最小化处理。根据测试化合物的对接构象，我们分别构建了水通道蛋白1、4、5的位点1和位点3的四个对接模型（图1、2）。最终按评分值和结合位点归属对潜在水通道蛋白配体进行归类：
• 结构结合位点相似的水通道蛋白1和4中，位点1获评607分，位点3获评340分；
• 水通道蛋白5中，位点1获评724分，位点3获评343分。

最终针对不同靶标分别整理出相应的化合物子集以供后续分析。