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由于天然产物及其衍生物具有高度复杂的生物和化学多样性,其已被用于探索生物相关领域。天然产物及其衍生物对于药物发现的重大影响是基于其嵌入的生物合成分子识别来发挥作用的。天然产物及其衍生物的三维结构多样性也是至关重要的,因为分子构型是生物分子识别分子的最重要因素之一。该库包含1479个基于药效团3D相似性度量的聚类和738个独特的杂环。该化合物库主要的设计理念是3D结构、药效团多样性和药物相似性。3D库相对于2D库的优势在于更高的sp3和QED值从每个簇中选择最多样化和最活跃的分子。