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目前报道的PDK1抑制剂大多为ATP竞争性抑制剂,靶向激酶的ATP结合位点。我们分析了10个PDK1抑制剂复合物的PDB结构,选取其中1UU3编号的晶体结构用于针对内部数据库的虚拟筛选。基于参与蛋白质-配体相互作用的关键残基特征构建了蛋白结合位点筛选模型:Ala162、Ser160、Thr222、Val143、Glu166(负责极性相互作用);Leu159、Leu212、Thr222、Val143、Tyr170(疏水作用区域)(图1)。通过UNITY应用模块(SYBYL-X)构建结合位点查询模型,包含供体、受体和2个疏水位点,并设置表面体积约束。采用UNITY柔性搜索工具对预处理的分子库进行虚拟筛选,最终通过QFit评分函数筛选出候选化合物。








































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