PDK1靶向化合物库

尤其重要的是，几乎半数的常见人类肿瘤类型，包括乳腺癌、肺癌、胃癌、前列腺癌、血液系统肿瘤和卵巢癌，在调控PIP3产生的基因中具有突变，导致PDK1过度刺激和AGC激酶的活化。PDK1抑制剂在体外和体内对癌细胞生长的影响表明，PDK1是一个有效的药物靶点。累积的证据表明，PDK1是一个有前途的治疗靶点，其抑制可能有助于防止癌症的进展和异常组织扩散。
大多数已描述的PDK1抑制剂是ATP竞争性抑制剂，靶向激酶的ATP结合位点。我们分析了十个PDK1抑制剂复合物的PDB结构，并选择在1UU3 PDB条目中记录的结构，以进行潜在抑制剂在Life Chemicals库化合物集中的计算筛选。根据负责蛋白质-配体相互作用的残基特征（Ala162、Ser160、Thr222、Val143、Glu166负责极性相互作用的残基；Leu159、Leu212、Thr222、Val143、Tyr170的疏水区域），构建了蛋白质结合位点的筛选模型。结合位点的查询模型是在UNITY Application（SYBYL-X）中准备的，包括给体、受体和2个疏水位点以及表面体积约束。使用UNITY Flex Search工具对准备的分子集进行虚拟筛选。最终的命中化合物集是通过QFit评分函数进行选择的。

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。