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SCR130 (1,7,9-Triazaspiro[4.5]dec-1-ene-6,10-dione, 2,4-bis(4-chlorophenyl)-8-thioxo-) 是基于 SCR7 的 DNA 非同源末端连接抑制剂，可诱导细胞凋亡并，具有抗癌活性。 它特异性依赖连接酶 IV，抑制 DNA 的末端连接。

NSC 617145 (NSC617145) 是一种 WRN 解旋酶抑制剂，IC50值为 230 nM。它以浓度依赖性方式抑制 WRN 解旋酶的 ATP 酶，并诱导双链断裂和染色体异常。

PFM01 是 MRE11核酸内切酶抑制剂，是 N-烷基化的 Mirin 衍生物。它可以通过非同源末端连接 (NHEJ) 和同源重组 (HR) 调节双链断裂修复 (DSBR)。

NHEJ inhibitor-1 (Compound C2) 是一种三功能 Pt(II) 复合物，可缓解非同源末端连接 (NHEJ) 同源重组 (HR) 相关的双链断裂 (DSB) 修复，从而避免非小细胞肺对顺铂的耐药性。NHEJ inhibitor-1 抑制损伤修复蛋白 Ku70 和 Rad51，从而使肿瘤对活性分子重新敏感。NHEJ inhibitor-1 还诱导 ROS 产生和MMP 降低。

VX-984 (M9831) 是一种可口服的、具有选择性的的、可透过血脑屏障的 DNA-PK 抑制剂。VX-984 对非同源性末端 NHEJ 的接合具有抑制作用，可作用于 DSBs 使 DNA 双链断裂。VX-984常见于对胶质母细胞瘤 (GBM) 和非小细胞肺癌 (NSC-LC) 的研究。

KU-57788 (NU7441) 是一种 NHEJ 通路抑制剂，抑制 PI3K 和 mTOR，IC50分别为 5.0 和 1.7 μM。 它是高效的选择性DNA-PK 抑制剂，IC50为 14 nM。

DMNB (6-Nitroveratraldehyde) 可用于合成no-carrier-added 6-[18F]fluoro-L-DOPA (6-FDOPA)。它可用于研究多巴胺能系统的PET。

SCR7 pyrazine (SCR7) 是一种 DNA 连接酶 IV 抑制剂，以连接酶 IV 依赖的方式阻断非同源末端连接。它也是 CRISPR Cas9的增强子，可提高 Cas9 介导的同源性定向修复的效率。它诱导细胞凋亡，具有抗癌活性。

TMU 35435 作为一种HDAC (组蛋白去乙酰化酶) 抑制剂，通过抑制DNA-PKcs（DNA 依赖性蛋白激酶催化亚基）的泛素化来阻断NHEJ通路。此外，该化合物通过促进TNBC中错误折叠蛋白的聚集及自噬作用(autophagy)，增强了对放射线的敏感性。

DDRI-18 是一种调节 DNA 损伤反应的新型小分子抑制剂，具有增敏活性和抗癌活性，抑制非同源末端连接 (NHEJ) DNA 修复过程，增强抗癌 DNA 损伤化合物的细胞毒性作用。

SCR7 是一种特异性 DNA 连接酶 IV 抑制剂，可阻断非同源末端连接。它是一种不稳定的形式，可以自动循环成​​稳定形式的 SCR7 pyrazine。它也是CRISPR Cas9的增强子，可提高 Cas9 介导的同源性定向修复的效率。它诱导细胞凋亡并具有抗癌活性。

YU238259 是一种新型的同源依赖性 DNA 修复 (HDR) 抑制剂，在基于细胞的 GFP 报告基因检测中不抑制非同源末端连接 (NHEJ)，可研究癌症。

5-Hydroxy Lansoprazole Sulfide is an inhibitor of fatty acid synthase (FASN). FASN, which is responsible for de-novo synthesis of lipids, has been found to be overexpressed in cancerous tissue. 5-Hydroxy Lansoprazole Sulfide specifically inhibits enoyl reductase, and was found to more effectively inhibit FASN function than lansoprazole and was also more efficient at regulating NHEJ repair of oxidative DNA damage via PARP1.