EN冠状病毒库

库设计
为设计我们的化合物文库，我们系统性地收集了所有最有前景的 SARS-CoV-2 蛋白靶点的现有结构信息。我们对这些蛋白质结构进行了详细分析，并建立了分子对接模型。这些对接模型通过短时间的分子动力学模拟进行了验证，并借助与已报道活性分子形成复合物的能力进行了确认。我们聚焦于以下5个靶点及非结构蛋白，据报道，它们对病毒传播至关重要，且为病毒复制所必需：
• SARS-CoV-2 主蛋白酶
• RNA 依赖性 RNA 聚合酶
• 木瓜样蛋白酶
• 血管紧张素转换酶 2 受体
• II 型跨膜丝氨酸蛋白酶
• 具有已报道三维结构的 SARS-CoV-2 非结构蛋白
对于半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶，我们进行了共价对接研究，以筛选有前景的共价结合剂，从而延长抑制作用。筛选化合物数据库经过了初步过滤，仅保留了含有针对每种氨基酸具有选择性的特定"弹头"结构的化合物。
所有其他以靶点为导向的子化合物库均通过了严格的药物化学筛选标准，包括PAINS（泛活性化合物）和分子参数限制，以主要表征类先导化合物空间。从我们的化合物库中发现的苗头化合物，可便捷地利用类似物和结构扩展策略进行后续研究，从而最大化结构内的药物化学多样性。

对接结果的例子

分子性质

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。