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1M6 (1-Methyl-6-nitroisatoic anhydride) 是一种 SHAPE 试剂,可用于检测 RNA 化学结构。
1M6 (1-Methyl-6-nitroisatoic anhydride) 是一种 SHAPE 试剂,可用于检测 RNA 化学结构。
规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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5 mg | ¥ 287 | In stock | |
10 mg | ¥ 397 | In stock | |
25 mg | ¥ 658 | In stock | |
50 mg | ¥ 959 | In stock | |
100 mg | ¥ 1,390 | In stock | |
500 mg | ¥ 3,550 | In stock |
产品描述 | 1M6 (1-Methyl-6-nitroisatoic anhydride) is a SHAPE reagent for the detection of RNA chemical structures. |
体外活性 | 一、 SHAPE 实验 1.RNA 样本准备:提取并纯化目标 RNA 样本,确保其未受污染且可以在 SHAPE 实验中稳定存在。 2.试剂反应:将 1M6 溶解在适当的溶剂中(如水或缓冲液),并加入到 RNA 样品中。通常,反应是在室温下进行,时间可根据实验设计调整(通常为 10-30分钟)。 3. RNA 修饰:1M6 会与 RNA 分子中的暴露 2'-OH 羟基反应,形成修饰后的 RNA 分子。这些修饰标记的 RNA 片段可以通过不同的测序技术(如高通量测序)进行分析。 4. 分析:分析RNA修饰数据,使用 SHAPE 数据生成 RNA 的结构模型,预测其二级结构或探究其与其他分子之间的交互关系。 二、研究 RNA 结构与功能 1. RNA 二级结构分析:在 RNA 样本中使用 1M6 进行修饰,通过分析修饰的位置来推测 RNA 的二级结构。 2. 相互作用研究:结合其他实验方法(如亲和层析或电泳)来研究 RNA 和其他分子(如蛋白质、小分子配体)之间的相互作用,评估这些相互作用对 RNA 结构的影响。 三、 RNA 折叠动力学研究 1.动态实验:通过在不同时间点添加 1M6,标记 RNA 在折叠过程中不同区域的结构变化。结合实时测序技术,研究 RNA 折叠的过程和中间体。 2.温度梯度实验:在不同温度条件下反应,评估 RNA 在不同热力学条件下的稳定性。 四、RNA 与小分子结合研究 1. 与小分子结合:将小分子添加到 RNA 样本中,使用 1M6 进行标记,分析 RNA 结构变化。 2.对比分析:通过对比未处理和小分子处理的 RNA 样本中 1M6 的修饰数据,识别与小分子结合的结构区域。 |
别名 | 1-Methyl-6-nitroisatoic anhydride, 1M-6, 1M 6 |
分子量 | 222.15 |
分子式 | C9H6N2O5 |
CAS No. | 4693-01-0 |
Smiles | O=C1OC(N(C)C2=CC=C([N+]([O-])=O)C=C12)=O |
密度 | 1.551g/cm3 |
存储 | Powder: -20°C for 3 years | In solvent: -80°C for 1 year | Shipping with blue ice./Shipping at ambient temperature. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶解度信息 | DMSO: 50 mg/mL (225.07 mM), Sonication is recommended. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液配制表 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DMSO
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以上为“体内实验配液计算器”的使用方法举例,并不是具体某个化合物的推荐配制方式,请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解方案。
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