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RNA 分子可以形成明确定义的二级结构,如双螺旋、发夹、隆起、内循环、干、这些结构为设计治疗药物提供了结构基础。我们在设计RNA 靶向库(共计2894种化合物)时考虑了这些结构特征。该库是一个特殊的筛选库,包含了根据不同类型的二级结构预测与RNA 相互作用活性的化合物。
这些化合物是使用最活跃的模板化合物通过贝叶斯模型选择的。另外,我们从PubChem数据库中收集了一组miRNA靶向化合物的训练集。为每个训练集开发了两个模型。第一个基于FCFP6指纹,第二个基于ECFP6指纹。为了提高模型的准确性,在构建模型时涉及了分子描述符,如LogP、分子量、氢供体和受体的数量、可旋转键的数量、环的数量和分子极性表面积。因此,RNA靶向文库中的化合物与典型的RNA靶向化合物的物理和结构参数相匹配,并含有RNA结合所需的重要分子片段。该文库仅包含类药物化合物,为转录后基因调控研究、抗癌、抗病毒和抗菌药物发现提供了良好的基础。
RNA靶标化合物库特征总结:





