PDZ PPI化合物库

PDZ PPI Library

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ChemDiv 的 PDZ aaaaPPI 库包含3055个化合物。 PDZ 结构域是一类丰富的蛋白质相互作用模块，能够识别靶蛋白质 C-末端的短氨基酸基序。它们调节着广泛的生物过程。 PDZ 结构域通常由80-100个氨基酸残基组成，具有相似的拓扑结构：PDZ 结构域通常由6个β折叠（βA ~ βF）、一个短α螺旋（αA）和一个长α螺旋（αB）组成。PDZ 结构域的 N-和 C-末端在规范的结构中靠近彼此，位于与肽结合位点相对的一侧，形成在αB 螺旋和βB 折叠之间的凹槽。PDZ 结构域在αB 和βB 结构元素之间的凹槽中具有单一的结合位点，其中一个高度保守的羧酸盐结合环位于βB 折叠之前。PDZ 结构域的环区域在配体结合中起着关键作用。含有 PDZ 结构域的蛋白质可以与数十个蛋白质发生相互作用。PDZ 蛋白质相互作用的调节机制包括磷酸化、二硫键形成、自抑制、竞争性结合和变构。 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）对细胞功能至关重要，其失调与多种疾病有关。由于 PDZ 结构域具有定义明确的结合位点，因此为进一步的使用提供了有希望的目标。该结构域在 142 个人类蛋白质中出现了 257 次。研究发现，一些 PDZ 结构域与疾病的发生发展有关，并且/或者与疾病相关蛋白相互作用。这些疾病包括癌症、囊性纤维化、精神分裂症、阿尔茨海默病、帕金森病、禽流感、疼痛和中风。 有助于克服多肽缺点的方法之一是使用小分子。PDZ 结构域参与了疾病的发病途径，这为开发能够选择性地针对 PDZ 介导的相互作用来抑制 PPI 的抑制剂提供了理论依据。这种小分子的一个例子是通过虚拟文库筛选确定的吲哚 8，它能够抑制 MAGI3 的 PDZ2 结构域，MAGI3 是一种适配蛋白，在调控组织组织和分化方面具有重要作用"。

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