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PPI Focused BBs Collection
普林斯顿生物分子研究中心的PPI(蛋白质-蛋白质相互作用)分子砌块库包含400个化合物。
最近发表的研究表明,与大多数蛋白质更常规结合位点的抑制剂相比,PPI(蛋白-蛋白相互作用)抑制剂通常体积更大、亲脂性更强。其中一个颇具前景的假设是:在具有较高亲脂性的外围取代基中,结合一个高度疏水的核心结构。考虑到生物活性化合物的化学空间已趋于饱和,其中富含sp²杂化的芳香结构常常导致毒性和代谢活性差的问题,我们提出精心设计并合理选择一系列疏水性更强、更具三维结构的构建模块(building blocks,简称BBs,富含sp³杂化),这些模块可作为合成潜在PPI抑制剂的核心结构。
多年来,我们团队一直致力于具有多个多样化位点、富sp³碳骨架的新型构建模块的设计与合成工艺优化,已成功开发出超过400种独特的化学类型(chemotypes)。我们采用了一系列筛选参数与分子描述符相结合的方法,用于评估这些构建模块的多样性,并筛选出具有成为潜在蛋白-蛋白相互作用(PPI)类药核心结构的构建模块。筛选过程中应用了以下参数: