HMG-CoA 还原酶抑制剂库

采用受体导向与配体导向相结合的策略构建。在受体导向部分，使用了HMG-CoA还原酶的晶体结构（PDB编号：2R4F）。配体导向部分则基于ChEMBL数据库中已知的HMG-CoA还原酶抑制剂训练集进行筛选。输入化合物（源自OTAVAchemicals药物样绿色化合物库）首先根据已知抑制剂的理化参数进行范围限定，随后通过分子对接、受体导向药效团搜索及三维定量构效关系（3D-QSAR）模型进行独立筛选。获得的分子对接复合物需根据对接得分阈值进行过滤，并检查其与活性位点关键残基之间的分子间疏水接触或氢键。最终筛选出两个子集：第一个子集包含通过分子对接和药效团方法获得的化合物，第二个子集则由分子对接与3D-QSAR方法共同筛选的化合物组成。为避免错误结合模式的配体，两个子集均经过人工目视核查。
该文库仅包含类药物化合物，为旨在胆固醇水平管理的研究和药物发现提供了良好的基础。