- 全部删除
您的购物车当前为空
算法:
- 应用 REOS、MedChem 和 PAINS 过滤器,去除整个 160 万 ChemDiv 清单中的反应性(如共价抑制剂)、毒性、杂乱性和其他不良结构基元。
- 然后使用物理化学性质过滤器(Lipinski Ro5)去除非药物分子 。
- 对于剩余的选择,应用内部开发的球形排除(“Batch Butina”)算法,同时聚类并挑选出最多样化的化合物。
- 进行最后的后处理,以确保
a. 仅存在至少 5 个代表性分子的聚类--仅保留 SAR 准备集(排除单体等)
b. 簇间相似度不超过 0.7(Tanimoto,ECFP4 2048)--确保簇的多样性
c. 每个簇内的化合物相似度不超过 0.85(Tanimoto,ECFP4 2048)--建立更有意义的 SAR(不能有太微不足道的替换)。
化合物库特性:
- 总计 155691 个 Ro5 兼容化合物,不含 PAINS 和 REOS。
- 包含 21468 个不少于 5 个化合物的化合物簇
- 大多数化合物簇基于相同的支架,但某些化合物簇显示了支架的多样性,同时保留了 FP 的相似性--这应有助于可靠、快速地建立 SAR。








































很棒

|