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库设计
通过分析已知抑制剂的化学结构,我们发现其中绝大多数是AVR-3200侧链类似物,这些化合物在活性位点不易被病毒酶与天然核苷区分开来。
因此,综合考虑天然核苷及已报道的核苷类抗病毒药物的药效团特征与拓扑结构,我们从化合物筛选库中精心挑选了一系列核苷类似物,构建成本抗病毒化合物库。该文库中的化合物既含有类天然的结构片段,也包含了作为核苷生物电子等排体的多种杂环结构。此外,我们特别侧重筛选那些具有多个氢键供体的化合物,这类分子有潜力与蛋白的核苷结合位点形成类似天然核苷的相互作用模式。
以下是本抗病毒化合物库中部分代表性化合物的示例:
该库分子构成概述
所选化合物具有理想的药物/先导化合物类物理化学及结构特性,这些特性是核苷及其模拟物的典型特征:分子量150至400,计算LogP值-2至4;拓扑极性表面积小于150,可旋转键小于7;氢键供体数1至5,氢键受体数1至7。
该库被认为是开展广泛抗病毒药物发现项目的便捷起点。





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