核酸

Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一种发近红外（NIR）荧光的花青素荧光染料，常应用于小动物活体体内成像。 Cy5.5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等化合物。

Propidium Iodide (PI) 是一种可用于细胞染色的红色荧光染料，适用于荧光显微镜、共聚焦显微镜、流式细胞仪以及荧光计分析。在水溶液中，Propidium Iodide 的 Ex/Em 为 493/636 nm；与核酸结合后，PI-核酸的 Ex/Em 变为 535/617 nm，同时荧光信号增强 20-30 倍。

Acridine Orange hydrochloride 是可透过细胞的荧光染料。 它与核酸结合，导致光谱发射发生改变。它被用作超活体染色剂和荧光细胞化学。 它可能导致微生物发生突变。

BHQ3 Maleimide 属于荧光探针，可以消除背景荧光，可用于蛋白质标记、核酸标记和细胞成像。

Sulfo-Cy5.5是一种近红外荧光染料 (Ex=673 nm, Em=707 nm)，可用于标记生物分子，如肽，蛋白质和寡核苷酸[2]。

DFHO 是一种激发后可散发黄色荧光的 Corn 同源配体，用于活细胞中 RNA 的成像。

CY3 (Sulfo-Cyanine3) 是传统的蛋白质和核酸的橙色荧光标记物(λex=554, λem=568)。

1,8-Diazafluoren-9-one (DFO) 是一种用于使在多孔表面上，能够发现指纹的化学物质。

6-ROX (6-Carboxy-X-rhodamine) 是寡核苷酸的荧光标记物，其激发波长为514nm，发射波长为525nm。它是耦合至5-FAM 的受体，在FRET 成像中作为供体。

Acridine Orange base是一种细胞通透性荧光染料，能够与细胞中的DNA和RNA结合并发出不同颜色的荧光。它与双链DNA结合时发出绿色荧光（激发波长488 nm，发射波长520-524 nm），而与单链DNA或RNA结合时则发出红色荧光（激发波长457 nm，发射波长630-644 nm），可用于细胞周期分析和检测细胞凋亡。

Pyronin Y (Pyronine G) 是一种可插入 RNA 的阳离子染料，可以靶向包括 RNA，DNA 和细胞器的细胞结构。它能够与双链核酸(尤其是 RNA) 形成荧光复合物，半定量分析细胞 RNA。它可用于活细胞中核糖核蛋白复合物的特定 RNA 亚种的鉴定。

5-TRITC是一种胺反应性荧光染料，常用于标记蛋白质和核酸。它能够与蛋白质中的氨基基团反应，形成稳定的硫醚键，从而标记和检测特定蛋白质的存在和定位，产生激发/发射最大值约555/580 nm的亮红橙色荧光。

Proflavine Hemisulfate (3,6-Diaminoacridine hemisulfate) 是一种 DNA 嵌入剂，也是一种吖啶染料。它是抗菌剂，也可作为 Kir3.2孔阻滞剂，可研究与 Kir3.2 相关的神经系统疾病。

CY3-YNE (Sulfo-Cyanine3-alkyne) 是一种被生物标记基团炔烃标记的染料, 可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒（Ex/Em ：554/566nm）。

Dabcyl acid (DABCYL) 是一种最早的深色荧光猝灭剂。

1-Methyl-7-nitroisatoic anhydride (1M7) 是一种能够检测局部核苷酸的试剂。

5-FAM SE 是单一异构体，是用于标记肽、蛋白质和核苷酸的荧光标记试剂。它能够与胺反应，产生稳定的胺结合物。

1) Non-toxicity: belong to flower-stem dye, easy to biodegrade, no carcinogenic toxicity. 2) High sensitivity: at least 100pg ssDNA or RNA can be detected, which is 25 ~ 100 times higher than EB staining. 3) High SIGNal-to-noise ratio: the sample fluorescence signal is strong, while the background signal is low. 4) Simple operation: like EB, the dye does not degrade in the prefabricated gel and electrophoresis process;The dyeing process after electrophoresis takes only 30 minutes without decoloring or washing, and can be observed directly with ultraviolet gel transmission or visible light transmission.

CelRed nucleic acid gel stain 10,000× concentrate in water是一种用于核酸染色的荧光染料，可用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶中dsDNA， ssDNA或RNA的染色和检测。

Cyanine3 NHS Ester Tetrafluoroborate 是一种荧光标记试剂，含 Cy3 荧光团、NHS 酯活性基团和四氟硼酸盐稳定剂。Cyanine3 NHS Ester Tetrafluoroborate它可与生物分子上的氨基反应，用于蛋白质、抗体、核酸标记及细胞成像等生物分析领域。

Cy5.5 diacid, SE is commonly used in biomolecular labeling, fluorescence imaging and other fluorescence biological analysis. Cy5.5 dyes and their derivatives are widely used to label polypeptides, proteins and nucleic acids.

Fast Green free acid is a dye that resists acid once applied.

2-Aza-ε-adenosine (2-Aza-1,N6-ethenoadenosine) 是一种具有多功能的染料。在生物实验中，该染料作为一种关键工具，能够协助研究人员观察和分析细胞结构，追踪生物分子，评估细胞功能，区分细胞类型，检测生物分子，研究组织病理，并且用于监测微生物。其应用不仅覆盖了从基础科学研究到临床诊断的多种领域，还广泛用于如纺织品染色、功能性纺织品处理、食品添加色素及染料敏化太阳能电池等传统和新兴领域。

Pyren-1-ylmethanamine hydrochloride通常用作生物化学和分子生物学中的荧光探针，用于检测和研究核酸、蛋白质和其他生物分子。此外，它还用于分析化学中检测环境样品中的重金属和其他污染物，分子中的芘基团表现出强烈的荧光特性，使其在各种应用中作为灵敏和选择性检测器。