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该库通过使用PRMT1、PRMT3和PRMT5的晶体结构进行基于受体的虚拟筛选进行设计。整个过程包括将药物样绿色库灵活地进行分子对接到PRMTs的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)结合口袋中。最终的化合物选择是通过检查与配体结合的活性位点的关键结构决定因素、对接评分以及与关键活性位点残基的分子间氢键进行的。
蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)靶向化合物库包含721个化合物。该库包括以下化合物集合:(1)蛋白质精氨酸甲基转移酶1靶向集合 - 106个化合物;(2)蛋白质精氨酸甲基转移酶3靶向集合 - 262个化合物;(3)蛋白质精氨酸甲基转移酶5靶向集合 - 381个化合物。该库仅包含药物样化合物(PAINS 化合物已经被过滤掉),为表观遗传药物发现提供了一个优质的基础。