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表观遗传靶点是成功药物研究的一个重要新类别。其中,蛋白质甲基转移酶(PMTs)是基因转录中起关键作用的一组重要酶类,在正常生理和人类疾病中扮演重要角色。蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)引起了人们的高度关注,它们能够催化蛋白质特定精氨酸残基上的氮甲基化反应,并通过甲基化不同的核蛋白、细胞质蛋白和膜蛋白底物,影响众多基本的生物途径。
PRMTs的异常调控或异常表达已在多种病理条件中发现,如癌症、炎症性疾病、病毒相关疾病、心血管疾病、肾脏疾病、神经退行性疾病、糖尿病和肺部疾病等。从药物发现的角度来看,PRMTs抑制剂的潜在治疗应用具有重要意义。此外,由于PRMTs在催化过程中涉及一个小有机辅因子,因此很可能同样适用于小有机分子的抑制剂。所有这些因素使PRMTs成为药物发现中可操作的化学靶点。我们提供了蛋白质精氨酸甲基转移酶靶向库(总共842个化合物)用于药物发现的早期阶段。该库通过使用PRMT1、PRMT3和PRMT5的晶体结构进行基于受体的虚拟筛选进行设计。整个过程包括将药物样绿色库灵活地进行分子对接到PRMTs的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)结合口袋中。最终的化合物选择是通过检查与配体结合的活性位点的关键结构决定因素、对接评分以及与关键活性位点残基的分子间氢键进行的。