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离子通道靶向化合物库(基于药效团)现货

Ion Channel Targeted Library (Pharmacophore Based)

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产品编号 LF9800

人类基因组测序已经鉴定出超过400种可能的离子通道,但其中只有一小部分被克隆并进行了功能测试。离子通道广泛分布于组织中,并且其开放和关闭带来了众多生理学效应,使得离子通道靶向药物发现变得非常引人注目。尽管已经有一些重要的药物在临床上使用,但许多现有药物的选择性较差,并且具有明显的毒性或亚组的疗效。
通过一种基于受体的方法,从我们的专有HTS化合物库中精心挑选了超过5,500个潜在的离子通道阻断剂,设计了一个原创的离子通道靶向化合物库。

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究,不能被用于人体,我们也不向个人提供产品和服务。
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产品编号 LF9800

离子通道靶向化合物库(基于药效团)

规格

  • 30 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 50 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 250 μL x 10 mM (in DMSO)
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产品描述 产品描述

本研究采用蛋白质数据库中十种人类离子通道靶点(与小分子离子通道调节剂形成的复合物)的X射线数据:
• 红藻氨酸1型离子型谷氨酸受体(GRIK1)
• 膜联蛋白V
• K钾离子通道亚家族K成员10
• 小电导钙激活钾通道蛋白2(SK2)
• 甘氨酸受体α-3亚基
• NMDA 2A型离子型谷氨酸受体(GRIN2A)
• 谷氨酸受体2(GluR2)
• 离子型谷氨酸受体GluR5
• 兴奋性氨基酸转运蛋白1(EAAT1)
• 囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)

针对每个复合物,我们构建了基于受体的药效团模型,其中包含描述结合模式的多种"特征":氢键供体、氢键受体、芳香环、疏水基团、正电荷或负电荷(图1)。每个模型均设有"排除体积",用于模拟配体周围结合位点的原子空间分布,从而在虚拟筛选中阻止化合物定位于这些空间点。
随后,使用预生成构象(每个化合物最多50个构象)将内部数据库对每个药效团模型进行筛选(图2-3)。初步获得的潜在离子通道调节剂经过五规则、PAINS过滤及内部药物化学过滤器处理,以去除含有"不良"基团及反应性基团的分子。
最终筛选集中选定了靶向离子通道的类药性化合物,这些化合物在对应药效团模型中显示出最佳匹配度。相关靶点信息及药效团"匹配度"评分已一并提供。

 Ion Channel Targeted Library (Pharmacophore Based)
图1. 基于甘氨酸受体α-3亚基与AM-3607结合的药效团模型。模拟受体原子的排除体积以蓝绿色球体表示。
 Ion Channel Targeted Library (Pharmacophore Based)
图2. 化合物与SK2离子通道药效团模型匹配的示例。模拟受体原子的排除体积以蓝绿色球体表示。
 Ion Channel Targeted Library (Pharmacophore Based)
图3. 化合物中匹配Annexin V药效团模型的示例。模拟受体原子的排除体积以蓝绿色球体表示。

包装和储存 包装和储存

  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

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