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库设计
该库经过精心设计,采用了结合了两种独立药效团模型和分子对接的方法。第一个模型基于七个晶体的超重叠(二肽基肽酶4与抑制剂的复合物)进行构建(PDB ID:2G5T,3VJM,3NOX,3KWF,2QJR,3HAB,2IIP)。第二个模型是使用从ChEMBL数据库中已知的DPP4抑制剂的训练集开发的三维药效团模型。从两个模型应用中得到的得分最高的化合物进一步在人类DPP4的晶体结构(PDB ID:1X70)中进行对接。最终的化合物选择是通过对接得分的筛选、与关键活性位点残基的分子间疏水接触和氢键的检查来进行的。