molecular docking

Toyocamycin (Vengicide) 是放线菌类产生的腺苷类似物，为 X 盒结合蛋白 1 (XBP1) 抑制剂，抑制 IRE1α 诱导的 ATP 依赖性 XBP1 mRNA 的断裂，IC50值为 80 nM。它还诱导凋亡。

1-Ethyl-4-methylbenzene对t4 lysozyme具有分子对接活性(Kd=120μM),可用于生化实验和药物合成。

1-Ethyl-2-methylbenzene对t4 lysozyme具有分子对接活性（Kd=505μM）,可用于生化实验和药物合成。

Tris(2,4-di-tert-butylphenyl)phosphate (TDTBPP) 分离自 Vitex negundoL，可以抑制分泌性磷脂酶 A2 (sPLA2)。Tris(2,4-di-tert-butylphenyl)phosphate 具有抗炎活性。

VR17-04，Enisamium的一种代谢产物，能够阻止在RNA合成过程中GTP与UTP的嵌入。通过对接和分子动力学模拟揭示了其作用机制。这些研究成果表明，VR17-04可作为管理COVID-19的潜在抗病毒策略。

PSB-22269 是一种 GPR17 拮抗剂，其 Ki 值为 8.91 nM。它在 cAMP 和 G 蛋白激活实验中表现出显著的抑制作用。分子对接研究显示，PSB-22269 的结合位点包括带正电荷的精氨酸残基和一个疏水性口袋。PSB-22269 提供了一种用于促进髓鞘再生的研究方法，有望应用于多发性硬化症的研究领域。

(1S)-Calcitriol (1α,25-Dihydroxy-3-epi-vitamin-D3) is a natural metabolite of 1α,25-dihydroxyvitamin D3 (1α,25(OH)2D3). (1S)-Calcitriol exhibits potent vitamin D receptor (VDR)-mediated actions such as inhibition of keratinocyte growth or suppression of parathyroid hormone secretion[1]. 3‐epi‐Calcitroic acid is an end product of (1S)-Calcitriol (1α,25-Dihydroxy-3-epi-vitamin-D3; 3‐epi‐1a,25(OH)2D3) metabolism by rat CYP24A1[1]. [1]. Steve Y Rhieu, et al. Metabolic stability of 3-epi-1α,25-dihydroxyvitamin D3 over 1 α 25-dihydroxyvitamin D3: metabolism and molecular docking studies using rat CYP24A1. J Cell Biochem. 2013 Oct;114(10):2293-305.

Celecoxib carboxylic acid is an inactive metabolite of the COX-2 inhibitor celecoxib .1,2It is formed from celecoxib primarily by the cytochrome P450 (CYP) isoform CYP2C9. 1.Liu, H., Huang, X., Shen, J., et al.Inhibitory mode of 1,5-diarylpyrazole derivatives against cyclooxygenase-2 and cyclooxygenase-1: Molecular docking and 3D QSAR analysesJ. Med. Chem.45(22)4816-4827(2002) 2.Kim, S.-H., Kim, D.-H., Byeon, J.-Y., et al.Effects of CYP2C9 genetic polymorphisms on the pharmacokinetics of celecoxib and its carboxylic acid metaboliteArch. Pharm. Res.40(3)382-390(2017)

Songorine (Napellonine) 是从乌头属中分离出的一种二萜生物碱，具有抗癌、抗心律不齐和抗炎活性。它是大鼠脑中的GABAA 受体拮抗剂，有用于上皮性卵巢癌的研究潜力。

AChE BChE-IN-20 (compound 3m) 是一种有效针对乙酰胆碱酯酶 (AChE,IC50=34.81 µM) 和丁基胆碱酯酶 (BChE,IC50=20.66 µM) 的抑制剂.该化合物通过分子对接和动力学模拟,展现了与关键酶口袋的高亲和力以及良好的相互作用特性,潜在应用于阿尔兹海默病的相关研究.

Perlolyrine(Tribulusterine)是一种天然的生物碱，与MAPK1, MAPK14和SRC具有分子对接能力（−5.73~-6.59 kJ mol），具有潜在的抗癌和抗炎作用。