Hypocrellin A 是一种天然的PKC抑制剂，具有光诱导的抗肿瘤、抗真菌和抗病毒活性，还对 MHC 限制性抗原呈递发挥免疫调节作用。

Hypericin (Cyclosan) 属于天然蒽醌类化合物，是贯叶连翘的提取物，可以抑制 PKC、MAO、多巴胺-beta-羟化酶、逆转录酶、端粒酶和 CYP等。Hypericin 具有抗菌、抗病毒、抗肿瘤和抗抑郁活性。

Deoxylapachol 是新西兰褐藻Landsburgia quercifolia 的主要细胞毒性成分，有抗真菌和抗癌活性。

Emodin (Frangula emodin) 是蒽醌衍生物，有抗SARS-CoV 作用。它阻断 SARS 冠状病毒刺突蛋白和血管紧张素转化酶 2 的相互作用。它抑制酪蛋白激酶 2 ，具有抗炎和抗癌作用。它可改善饮食诱导的肥胖小鼠的代谢紊乱。

β,β-Dimethylacrylalkannin 是一种萘醌类化合物，分离自紫草属植物中，可以提高皮肤细胞中胶原蛋白和内披蛋白的含量。

Menadione (Vitamin K3) 是合成的萘醌，能够在体内转化成活性维生素 K2。

Plumbagin (Plumbaein) 是一种萘醌类物质，从Plumbago zeylanica L 中获得，具有抗肿瘤、抗增殖作用。

Vitamin K1 (Phylloquinone)是天然存在的维生素。Vitamin K1是血液凝固，骨和血管代谢所必须的。

Physcion 1-O-beta-D-glucoside 是一种 Fallopia multiflora 的活性成分，可用于头晕的研究。

Acetylshikonin 来源于紫草根，具有抗癌、抗炎作用。它是一种 AChE 抑制剂，具有很强的抗凋亡活性。它是一种非选择性的细胞色素 P450抑制剂，对所有 P450 亚型抑制的 IC50值范围为 1.4-4.0 μM。

Homoembelin (2,5-dihydroxy-3-nonyl-1,4-benzoquinone) 是来自 E. ribes 和 C. monocarpus 的色素，具有抗菌效果，可用于耐多药细菌感染的研究。

alpha-Tocopherolquinone (Metarene) 会下调线粒体的呼吸活动。在还原为生育酚氢醌后，它还显示出抗氧化活性。在大鼠缺氧期间，已发现它的水平升高。

Deoxyshikonin (Arnebin 7) 是从紫草中分离的天然产物，具有抗肿瘤活性，在体外具有促血管生成作用。它和没食子酸十二烷基酯在体内外均与青霉素有显着的协同抗菌活性。

Protohypericin 是一种从贯叶连翘中提取的天然石脑粉。放射性碘化 Protohypericin 能用于肿瘤坏死靶向放射研究。

β,β-Dimethylacrylshikonin (Dimethylacrylshikonin) 是一种萘醌衍生物，从 Arnebia nobilis 中提取得到。它利用 PI3K 通路诱导 eNOS、VEGF 和 HIF-1α 的表达，促进血管生成，具有抗肿瘤活性。

2,6-Dimethoxyquinone 是一种植物中提取吸脂诱导因子。它具有抗脂肪、抗癌、抗菌、抗疟疾和抗炎的作用。

Coenzyme Q10 (CoQ10)是来自藤仓赤霉菌的一种天然产物，在线粒体呼吸链中充当电子载体。

Oosporein 是一种由三侧盲杆菌产生的霉菌毒素，具有抗菌、抗病毒和杀虫活性，抑制 P. infestans，抑制单纯疱疹病毒 1 型 DNA 聚合酶，可用于研究病毒感染。

Alizarin (Mordant Red 11) 是一种天然红色染料，从茜草植物根部提取得到，已广泛用作纺织品和绘画中的颜料。

Physcion (Physcione) 是一种从中药大黄中分离的蒽醌，作为 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶的抑制剂，IC50和 Kd 值分别为 38.5 μM 和 26.0 μM。它具有通便、保肝、抗炎、抗菌、抗增殖、抗肿瘤作用。

Rhein (NSC 38629) 从蓼科大黄中提取的一种蒽醌类化合物，有抗炎、抗氧化、抗癌等作用。

Juglone (Regianin) 是一种从黑胡桃Juglans regia 中发现的黄色染料，有抗菌作用。

Aloin (mixture of A&B) 是一种从芦荟中分离出来的蒽醌衍生物。它是刺激性粒细胞基质金属蛋白酶的有效抑制剂。它具有多种生物活性，如抗炎、抗菌、抗真菌、抗氧化、抗肿瘤、抗糖尿病和免疫活性。

Hypocrellin B 是从真菌Hypocrella bambusae 和Shiraia bambusicola 中分离得到的一种感光颜料，可用于癌症光动力研究。它是一个凋亡诱导剂，还拥有抗菌和抗利什曼活性。

Diacerein (Fisiodar) 是一种慢效具有白介素-1β 抑制效果的蒽醌类化合物。

(-)-Alkannin (Shikonin) 是从紫朱草中发现的一种天然产物，具有抗癌活性，可抑制细胞周期，诱导细胞凋亡，用作食品着色剂，在 Rho 激酶途径中可改善肝脏炎症。

Demeclocycline (Declostatin) 是一种四环素类抗生素，产自金霉素链霉菌（Streptomyces aureofaciens）菌株。Demeclocycline 具有抗菌活性，能抑制血管加压素对肾小管的作用，从而导致利尿。Demeclocycline 可用诱导尿崩症和急性肾衰竭。

Obtusin 是来自决明子种子，是一种高度选择性和竞争性的人单胺氧化酶-A 抑制剂，IC50=11.12 μM，Ki=6.15 μM。它在神经退行性疾病，尤其是焦虑和抑郁中起预防作用。

Embelin (Embelic acid) 是从日本 Ardisia 草药中分离出来的一种非肽类细胞渗透性XIAP 抑制剂，诱导口腔鳞癌细胞自噬和凋亡。它阻断 NF-kappaB 信号通路，从而抑制 NF-kappaB 调节的抗凋亡和转移基因产物。在高水平 XIAP 的前列腺癌细胞中抑制细胞生长，诱导凋亡，并激活 caspase-9。

Rubiadin-1-methyl ether (Rubiadin 1-methyl ether) 是一种巴戟天中的蒽醌类化合物，能够抑制 NF-κB p65 的磷酸化和 IκBα 的降解以及减少 p65 的核转位，阻碍破骨细胞的骨吸收。

Obtusifolin 是分离自决明子的种子中，能够抑制NF-kB 通路，调节气道上皮细胞中 MUC5AC 粘蛋白的基因表达和产生。它通过靶向甲状旁腺激素相关蛋白来抑制邻苯二甲酸酯诱导的乳腺癌骨转移。

Lapachol (CI75490) 是从Tabebuia avellanedae 中分离得到的一种萘醌。它具有具有抗菌、抗炎、镇痛、抗肿瘤和抗生素特性。

2-(Hydroxymethyl)anthraquinone 是光可清除保护基团，在结构上可以阻碍性信息素释放。

(Rac)-Arnebin 1 (beta, beta-dimethylacrylshikonin) 具有抗肿瘤作用，是β,β-Dimethylacrylalkannin 和 β,β-Dimethylacrylshikonin 的消旋体。β,β-Dimethylacrylalkannin 和 β,β-Dimethylacrylshikonin 是分离自紫草属植物中的萘醌类化合物。

Purpurin (Verantin) 是来自Rubia tinctorumL. 的天然蒽醌，具有抗抑郁样作用。

Aloe emodin (Rhabarberone) 是从芦荟叶中提取出的一种羟基蒽醌，在体内外有抗肿瘤活性。

Lawsone methyl ether (2-Methoxy-1,4-naphthoquinone) 是从凤仙花和Swertia calycina 中分离出的，有抗真菌和抗菌活性。

Rapanone (2,5-Dihydroxy-3-tridecyl-[1,4]benzoquinone) 是一种具有广泛生物活性的天然苯醌，如抗肿瘤、抗氧化、抗炎、抗菌和抗寄生虫活性。它还是选择性人滑膜 PLA2抑制剂，IC50值为 2.6 μM。

Rubiadin (1,3-Dihydroxy-2-Methylanthracene-9,10-Dione) 是一种二羟基蒽醌，提取自茜草，具有抗氧化剂作用。

Danthron (Antrapurol) 是一种从中药 rhubarb 中提取的天然产物，可通过激活 AMPK 来调节葡萄糖和脂质代谢。

Rhein 8-Glucoside 是一种蒽醌糖苷，存在于大黄 (rhubarb) 中，显示出泻下活性。

Quinizarin (1,4-Dihydroxyanthraquinone) 是一种杀菌剂和杀虫剂，可抑制肿瘤细胞生长。

Carminic acid 是天然红色色素，是球虫染料家族中的一种。

Beta-Acetoxyisovalerylshikonin 是一种萘醌衍生物，提取自Arnebia euchroma 中。

Lawsone (Hennotannic acid) 是一种从Lawsonia inermis 的叶片中分离得到的萘醌染料，具有抗菌和抗氧化活性。

Tectoquinone 具有很强的杀蚊幼虫活性。

α-Lapachone 具有杀锥虫作用。

1,4-Anthraquinone 是一种抗癌药物，在体外与柔红霉素相同纳摩尔范围内阻断核苷转运、抑制大分子合成、诱导 DNA 片段化并降低 L1210 白血病细胞的生长和活力。它被提议为一种用于高效液相色谱 (HPLC) 测定药物制剂中 N-乙酰半胱氨酸 (NAC) 和卡托普利 (CAP) 的新型柱前试剂。