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MMP-9-IN-1 是特异性的基质金属蛋白酶-9 抑制剂，选择性靶向 MMP-9 的血红素域，对其他 MMP 无影响。

MMP13-IN-3 是口服有效的MMP-13选择性抑制剂，IC50为 1 nM，比其他 MMP 的选择性高 1000倍多。MMP13-IN-3在用于骨关节炎方面有研究的价值。

Edaravone (MCI-186) 是一种新型自由基清除剂，能够抑制大鼠与 MMP-9有关的脑出血。

Doxycycline 是一种口服有效的四环素类抗生素，具备广谱金属蛋白酶（MMP）抑制作用，兼具抗菌和抗肿瘤活性，并常用于诱导基因表达的 ON-OFF 体系。

Doxycycline (hyclate) 是一种口服有效的四环素类抗生素，具有广谱金属蛋白酶（MMP）抑制作用，兼具抗菌和抗肿瘤活性，常用于诱导基因表达的开关调控系统（ON-OFF系统）。

Ilomastat (GM6001) 是广谱的基质金属蛋白酶 (MMP) 抑制剂，可抑制 MMP 的活性，IC50值分别为 1.5 nM (MMP-1)，1.1 nM (MMP-2)，1.9 nM (MMP-3)，0.5 nM (MMP-9)，对人皮肤成纤维细胞胶原酶 (MMP-1) 的Ki=为 0.4 nM。

Astragaloside IV (AS-IV) 是从黄芪中分离得到的一种皂苷，抑制ERK1/2和JNK 激活，在乳腺癌细胞 MDA-MB-231 中，下调(MMP)-2和(MMP)-9的信号通路。

Marimastat (BB2516) 是一种血管生成和转移抑制剂，限制血管的生长和生成。它是一种广谱的，具有口服活性的MMPs 抑制剂，有效抑制 MMP-9 , MMP-1, MMP-2, MMP-14, MMP-7，用于癌症的研究。

Salvianolic acid A (Dan Phenolic Acid A) 属于天然产物，是一种基质金属钛酶 9 (MMP-9) 的抑制剂。Salvianolic acid A 具有抗氧化和抗炎活性，可以保护血脑屏障。

PG-116800 (PG-530742) 是一种基质金属蛋白酶 (MMP) 抑制剂。 PG-116800 可用于骨关节炎治疗的研究。

Chloramphenicol (Chloromycetin) 是一种广谱抗生素，有效抑制细菌蛋白质生物合成。Chloramphenicol 主要作用于细菌 70S 核糖体的 50S 亚基，对肽基转移酶有活性，抑制肽键的形成。

Fenofibric acid (FNF acid) 是 fenofibrate 的活性代谢物，是PPAR 激动剂，对 PPARα、PPARγ 和 PPARδ 的EC50值分别为 22.4、1.47 和 1.06 µM。它抑制COX-2的活性，IC50值为 48 nM。

Acetohydroxamic acid (N-Hydroxyacetamide) 是一种不可逆的细菌和植物尿素酶抑制剂，可研究慢性尿路感染。

Nobiletin (Hexamethoxyflavone) 是一种来自柑橘皮的聚甲氧基黄酮，是RORs 激动剂，可改善记忆力丧失。它可降低分化的 C2C12 肌管中的ROS 水平，并具有抗炎，抗癌，抗血管生成，抗增殖，抗转移和诱导细胞凋亡作用。

Arctigenin ((-)-Arctigenin) 是一种存在于牛蒡中的木脂素，具有抗氧化、抗肿瘤、抗炎和抗病毒活性。它可研究代谢紊乱和中枢神经系统功能障碍。

Stigmasterol (Stigmasterin) 是一种植物甾醇，具有维持细胞膜结构和生理的主要功能。Stigmasterol 可以降低胆固醇水平，具有抗肿瘤、抗炎、免疫调节作用。

Chondroitin sulfate (Chonsurid) 是一种糖胺聚糖，被广泛用于骨关节炎的研究。它能够减少炎症介质和凋亡过程，并能够减少炎性细胞因子，iNOS 和MMPs 产生。

(-)-Epigallocatechin (Epigallocatechin) 是绿茶中含量最丰富的黄酮类天然产物，可与未折叠的天然多肽结合，阻止转化为淀粉样蛋白原纤维。

Cordycepin (3'-Deoxyadenosine) 是一种核苷衍生物，在类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中，剂量依赖性抑制 IL-1β 诱导的 MMP-1和 MMP-3表达。它也抑制细菌的腺苷激酶从而抗结核分枝杆菌。

Glycerol trioleate 是一种对称三酰甘油，可减少MMP-1的上调，具有很强的抗氧化、抗炎特性。

Auraptene 是一种丰富的天然香叶氧基香豆素。它能够抑制基质金属蛋白酶 2 以及关键炎症因子，包括 IL-6，IL-8 和趋化因子 (C-C 基序) 配体-5 (CCL5）的分泌。

Aloin (mixture of A&B) 是一种从芦荟中分离出来的蒽醌衍生物。它是刺激性粒细胞基质金属蛋白酶的有效抑制剂。它具有多种生物活性，如抗炎、抗菌、抗真菌、抗氧化、抗肿瘤、抗糖尿病和免疫活性。

Abametapir (BRN 0123183) 是一种金属蛋白酶抑制剂，能够靶向对卵孵化和虱子发育至关重要的金属蛋白酶。

Doxycycline monohydrate 是一种四环素抗生素，是广谱金属蛋白酶抑制剂，具有抗菌活性。