double-strand dna breaks

UNC-2170 (UNC2170 Maleate) 是53BP1(IC50=29 µM;Kd=22 µM) 选择性的、功能活性的片段状配体，对 53BP1 的选择性比其他九种甲基赖氨酸读取器蛋白质高出至少17倍。53BP1 是 Kme 结合蛋白，在 DNA 损伤修复途径中起核心作用，并被招募到双链断裂位点。

Irinotecan (CPT-11) 是喜树碱的衍生物，是一种 DNA 拓扑异构酶 I (Topo I) 的抑制剂。Irinotecan 通过与 Topo I 复合物结合来阻止 DNA 链的重新连接，并导致双链 DNA 断裂和细胞死亡，具有抗肿瘤活性。

Calicheamicin (Calicheamicin γ1) 是肿瘤抗生素，可引起DNA 双链断裂，抑制DNA 合成。

Neocarzinostatin is an effective DNA-damaging, anti-tumor antibiotic. It recognizes double-stranded DNA bulge and induces DNA double strand breaks (DSBs). Neocarzinostatin leads to apoptosis. Neocarzinostatin has potential for EpCAM-positive cancer treatment.

5-BrdUTP sodium salt is a TdT substrate used for labeling DNA double-strand breaks.

XSJ05，一种喜树碱 (CPT) 衍生物，能有效抑制拓扑异构酶 I (Topo I) 以发挥抗癌作用。该化合物能促使 DNA 双链断裂，进而引起 DNA 损伤。此外，XSJ05 对抑制结直肠癌 (CRC) 生长具有显著效果，能使细胞周期在 G2/M 期暂停，并能诱导细胞凋亡 (apoptosis)。

PARP1-IN-27 (Compound 9B)，作为PARP1和PARP2的有效抑制剂，在SUM149PT细胞中的IC50分别达到2.53 nM和6.45 nM。此外，PARP1-IN-27对BRCA突变癌细胞系SUM149PT、HCC1937和Capan-1的增殖抑制效果显著，相应的IC50值为0.62、1.91和4.26 μM。该化合物能够加剧DNA双链断裂，促进ROS生成，并在G2/M期阻滞细胞周期，最终在SUM149PT细胞中触发细胞凋亡(apoptosis)。

GSK_WRN4 作为一种 WRN 解旋酶抑制剂，具有抗癌活性，通过引发 DNA 双链断裂抑制 MSI 肿瘤细胞的生长，可用于研究癌症。

AcBut-N-Ac-γ-Calicheamicin 是一种 ADC 毒素，通过引发 DNA 双链断裂导致细胞周期停滞和凋亡 (Apoptosis)。其主要用于抗体药物偶联物 (ADC) 的合成，有潜力应用于癌症研究，特别是急性淋巴细胞白血病 (ALL) 和其他血液系统恶性肿瘤的研究。

Tilatamig samrotecan (AZD9592) 是一种抗体偶联药物（ADC），用于递送拓扑异构酶I抑制剂（TOP1i），以靶向表皮生长因子受体（EGFR）和c-MET，展现抗肿瘤作用。Tilatamig samrotecan (AZD9592) 能诱导DNA双链断裂，增加pRAD50和γH2AX的表达，从而抑制非小细胞肺癌的生长。

HDAC-IN-85 (Compound 1) 是一种能够通过血脑屏障的HDAC抑制剂，对脑肿瘤细胞系表现出抑制作用。它可以诱导乙酰化，导致DNA双链断裂，并诱导RAD51泛素化，从而破坏DNA修复过程。HDAC-IN-85 可用于胶质母细胞瘤的研究。

Multi-target kinase inhibitor 4 (Compound 2) 是PI3K/DNA-PK抑制剂与强效化学增敏剂，能够增加Doxorubicin引起的DNA双链断裂数量。它是有效的多药耐药性(MDR)抑制剂，对P-糖蛋白(P-gp)介导的药物外排具有活性抑制作用。同时，该化合物可负载于PEG包覆的脂质纳米粒中。

NBTIs-IN-7 (compound 276) 是一种新型细菌拓扑异构酶抑制剂（NBTIs），能在回旋酶存在下诱导单链和双链 DNA 断裂。

CDK9/EZH2-IN-1 是一种针对 CDK9 和 EZH2 的双重抑制剂，IC50 分别为 83.9 nM 和 108.6 nM。它可以诱导细胞凋亡 (Apoptosis) 和 DNA 双链断裂 (DSB)。此化合物有效抑制 MKN45、MDA-MB-453 和 SW620 癌细胞的增殖，IC50 分别为 136.3 nM、171.3 nM 和 315.7 nM。

HQY1428 是一种可口服的 CDK12 抑制剂。它通过抑制 DNA 复制使 SKOV3 细胞在 G2/M 期停滞，并诱导 DNA 双链断裂和细胞凋亡 (Apoptosis)。HQY1428 在 SKOV3 异种移植小鼠模型中显示出抗肿瘤活性。在 NCI-N87 异种移植小鼠模型中，HQY1428 与 HER2 抑制剂 Lapatinib 联合使用，能够产生协同的治疗效果。

7-tert-Butylfascaplysin (7-TB) 是 Fascaplysin 的一种衍生物，能够从 Fascaplysinopsis sp. 中提取。它能诱导复制应激，导致 DNA 双链断裂及凋亡样细胞死亡，对癌细胞展现出纳摩尔级的细胞毒性。7-tert-Butylfascaplysin 具有 DNA 插入活性，其 EC50 为 3.2 μM。

EXO1-IN-1 (Compound F684) 是一种高效和选择性的核酸外切酶 1 (EXO1) 抑制剂 (IC50= 15.7 μM)。其抑制 DNA 末端切除，促进 DNA 双链断裂积累，并引发 S 期聚酰胺化，从而破坏同源重组缺陷 (HRD) 癌细胞的 DNA 修复途径，选择性消灭具有 BRCA1/2 等同源重组基因缺陷的肿瘤细胞。EXO1-IN-1 有潜力用于研究同源重组缺陷癌症（如 BRCA 相关肿瘤）。

ML-20，作为Malabaricone C的类似物，是自噬 (autophagy) 抑制剂和放射增敏剂。它能够抑制细胞生长并诱导细胞凋亡 (apoptosis)。ML-20 会引起DNA双链断裂、线粒体膜电位丧失 (MMP) 和溶酶体膜渗透。由于LMP的作用，ML-20 引发内质网应激，同时抑制自噬通量。

XSJ110 是一种高效不可逆的拓扑异构酶 I (Topo I) 抑制剂，其IC50值为 0.133 μM。XSJ110 阻碍 DNA 的拓扑异构化，引发 DNA 双链断裂，并引起细胞周期停滞在 G0/G1 期，最终导致肿瘤细胞凋亡 (apoptosis)。XSJ110 有潜力用于壶腹癌 (AC) 的研究。

Etoposide Phosphate是一种选择性和可口服的topoisomerase II抑制剂和癌症化疗药品，通过DNA损伤、p53通路和细胞周期G2/M阻滞,抑制癌细胞的生长和诱导凋亡

COH29 (RNR Inhibitor COH29) 是一种口服可用的芳香族取代噻唑，是人类核糖核苷酸还原酶 (RNR) 的抑制剂，具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制核糖核苷酸还原酶的IC50为 16 μM。

Cylindrospermopsin, a tricyclic uracil derivative, is a cyanobacterial toxin that was first discovered in an algal bloom contaminating a local drinking supply on Palm Island in Queensland, Australia after an outbreak of a mysterious disease. Cylindrospermopsin targets protein and glutathione synthesis in hepatocytes (IC50s = 1.3 and 2.4 µM, respectively), leading to cell death. [1] It has been shown to inhibit the activity of the uridine monophosphate synthase complex with a Ki value of 10 µM.[2] Cylindrospermopsin is genotoxic, inducing DNA damage as evidenced by double strand breaks and reducing cell viability in HepG2 cells at 0.1-0.5 µg/ml.[3]

Topoisomerase II inhibitor 6 (Compound 5) 是色胺酮的衍生物。它是一种有效的拓扑异构酶的选择性抑制剂。Topoisomerase II inhibitor 6 在 G2 期阻断 CCRF-CEM 的细胞周期并诱导 DNA 双链断裂。Topoisomerase II inhibitor 6 对不同的肿瘤细胞系具有抗增殖活性，在癌症疾病研究中具有潜力。

p53 Activator 2 (compound 10ah) 插入DNA，导致显著的DNA双链断裂。该化合物通过增加p53、p-p53、CDK4、p21的表达，使细胞周期在G2/M期停滞，诱导细胞凋亡，并显著降低抗凋亡蛋白Bcl-2、Bcl-xL和cyclin B1的水平。此外，p53 Activator 2表现出对MGC-803细胞的抗增殖效果，其IC50为1.73 μM，且在MGC-803异种移植肿瘤模型中展示出有效的抗癌活性。