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反向找靶

反向找靶,也被称为靶点垂钓等。对于化合物已知疗效,但是,并不知道该化合物产生效果的机制时候,一般会采用反向找靶的方法。同时,由于通量、精度和费用的限制, 实验手段的应用有时难以广泛开展。采用理论方法进行靶点预测,具有快速而低成本的特点,成为了一种重要的辅助手段。

常见的理论方法有:

  • 1. 基于分子二维结构相似性的方法,该方法计算速度非常快,也不需要对小分子结构进行预处理。但是其预测结果取决于二维相似性的计算精确度,且不能预测训练集之外的未知结构
  • 2. 基于分子三维结构相似性的方法,该方法计算速度也比较快,其考虑小分子的三维形状和药效团特征,可以预测训练集之外的未知结构。该方法不适用于activity cliff情况的预测(即化合物结构差异很小而生物活性差别很大)。
  • 3. 基于反向分子对接的方法,该方法直接利用靶标结构信息,通过靶标与小分子的作用强度进行预测,但是,该方法计算速度比较慢、需要靶标三维结构、需要进行结构预处理、需要适合的评价函数。
  • 4. 基于生物活性谱图分析的方法,该方法基于化合物生物活性谱的相似性进行预测,精度较高,但是,该方法需要获得待测化合物的生物活性谱图,同时不同来源的生物活性数据需要进行处理。
反向找靶

药物潜在靶标的识别对于早期药物分子的研发、安全性评价和老药新用等领域都有着非常重要的意义,但是受制于通量、精度和费用的影响,实验手段的应用难以广泛开展。

作为一种快速而低成本的手段,计算机辅助的反向找靶算法的开发正在受到越来越多的重视,发展快速、精确的靶标识别预测方法对于靶向性药物开发、药物-靶标相互作用网络图谱的构建和小分子调控网络的分析都具有十分重要的意义。

我们的优势

  • 1、 提供多种方法进行实验。
  • 2、 对得到的结果进行合理性分析。

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