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库设计:
利用包括ChEMBL、Google Patents、SciFinder和Clarivate Cortellis Drug Discovery Intelligence在内的数据库,进行了针对靶向肥胖分子的全面搜索。该过程包括以下步骤:
1、参考化合物鉴定:从数据库中提取了一组具有已知或潜在抗肥胖特性的多样化化合物,重点关注已上市或处于肥胖治疗临床试验阶段的分子。
2、结构表征:对鉴定出的化合物的化学结构进行了全面分析。这包括分子描述符(如分子量、logP)、二维拓扑特征(如连接性指数)和三维构象特性(如形状指数)的评估。这种多维分析为每种化合物提供了全面的结构特征信息。
3、相似性评估:采用先进的化学信息学工具评估已知抗肥胖化合物与更大分子数据库之间的结构相似性。使用了多种指标,包括用于二维指纹的Tanimoto系数和基于三维形状的相似性度量,以识别结构相关的化合物。
4、库生成:基于与已知活性分子的结构相似性,创建了一个潜在抗肥胖化合物的聚焦库。重要的是,特意排除了针对GLP1R的化合物,以确保潜在作用机制的多样性并探索新的治疗方法。最终库由满足预定相似性阈值同时保持结构多样性的分子组成。